RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 KIF18AQ8NI77 898 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 CCDC102AQ96A19 550 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MYL10Q9BUA6 226 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 RBSNQ9H1K0 784 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MAGI2Q86UL8 1455 aa6.38□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 PTPDC1A2A3K4 754 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 PICALMQ13492 652 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 SYCP1Q15431 976 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 WDR78Q5VTH9 848 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 CCDC102BQ68D86 513 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MAGEB6Q8N7X4 407 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 AK7Q96M32 723 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 UIMC1Q96RL1 719 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 HMG20BQ9P0W2 317 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 CCDC171Q6TFL3 1326 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 LIG1P18858 919 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 ANAPC15P60006 121 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 SPECC1Q5M775 1068 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 KDM6BO15054 1643 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 B4E1Z4 1266 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 UBAP1LF5GYI3 381 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 JAK2O60674 1132 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 PTGS1P23219 599 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 TCERG1LQ5VWI1 586 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 UNC5CLQ8IV45 518 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 DCAF5Q96JK2 942 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 NLRP3Q96P20 1036 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 CEP131Q9UPN4 1083 aa6.37□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 TYRO3Q06418 890 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 PROSER3Q2NL68 480 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 SETDB2Q96T68 719 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 TSPYL1Q9H0U9 437 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 SNX14Q9Y5W7 946 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 H0YHG0 523 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 SGSM2O43147 1006 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 SKILP12757 684 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 STX1AQ16623 288 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 RTN1Q16799 776 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 DHX58Q96C10 678 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 KAT14Q9H8E8 782 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 RIMBP2O15034 1052 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 N4BP3O15049 544 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 UBASH3AP57075 661 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 GNG11P61952 73 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 TTLL7Q6ZT98 887 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 RUFY3Q7L099 469 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 TMOD2Q9NZR1 351 aa6.36□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 SPTLC2O15270 562 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 CCP110O43303 1012 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MBD4O95243 580 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 ERCC3P19447 782 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 TAX1BP1Q86VP1 789 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 FAM200AQ8TCP9 573 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MMRN2Q9H8L6 949 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MCM9Q9NXL9 1143 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 CTAGE5O15320 804 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 MYO1BO43795 1136 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 KCNQ4P56696 695 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 PTH1RQ03431 593 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 PDE4BQ07343 736 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 GCKRQ14397 625 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 TNNI3KQ59H18 835 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa6.35□□□□□ -1.39
LMO3-201ENST00000261169 DRC1Q96MC2 740 aa6.35□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms