RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cap1P40124 474 aa27.47■■□□□ 1.99
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Clca2Q8BG22 942 aa27.47■■□□□ 1.99
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AbraQ8BUZ1 375 aa27.46■■□□□ 1.99
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RragcQ99K70 398 aa27.46■■□□□ 1.99
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cnksr1A2A9K7 700 aa27.44■■□□□ 1.98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trappc12Q8K2L8 797 aa27.44■■□□□ 1.98
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP27.44■■□□□ 1.98
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 EhhadhQ9DBM2 718 aa27.43■■□□□ 1.98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttll12Q3UDE2 639 aa27.42■■□□□ 1.98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 B230104I21RikQ3USW4 141 aa27.42■■□□□ 1.98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttc14Q9CSP9 761 aa27.42■■□□□ 1.98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slfn1Q9Z0I7 337 aa27.42■■□□□ 1.98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 4931408C20RikE9PWP9 1381 aa27.41■■□□□ 1.98
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mtmr2Q9Z2D1 643 aa27.41■■□□□ 1.98
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Znf697Q569E7 569 aa27.4■■□□□ 1.98
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ndfip2Q91ZP6 311 aa27.4■■□□□ 1.98
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Acsl1P41216 699 aa27.39■■□□□ 1.98
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ttc19Q8CC21 365 aa27.39■■□□□ 1.98
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gpr37l1Q99JG2 481 aa27.39■■□□□ 1.98
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Col11a1Q61245 1804 aa27.39■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm6268A2A3U9 297 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cntnap3E9PY62 1287 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc10a4Q3UEZ8 437 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eif4g2Q62448 906 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc39a11Q8BWY7 342 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Heg1E9Q7X6 1337 aa27.38■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Chl1P70232 1209 aa27.37■■□□□ 1.97
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Large2Q5XPT3 690 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Akap4Q60662 849 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc4a7Q8BTY2 1034 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ccdc60Q8C4J0 545 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dclk1Q9JLM8 756 aa27.37■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q3UK37 420 aa27.36■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cavin2Q63918 418 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CoilQ5SU73 570 aa27.35■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lman1lQ8VCD3 505 aa27.35■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cwc25Q9DBF7 416 aa27.35■■□□□ 1.97
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mageb2A2AHM0 380 aa27.34■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NmiO35309 314 aa27.34■■□□□ 1.97
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zbtb38Q3LR78 1197 aa27.34■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Brca1P48754 1812 aa27.34■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Phrf1A6H619 1682 aa27.33■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa27.33■■□□□ 1.97
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Scn10aQ6QIY3 1958 aa27.32■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kifc2O08672 792 aa27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 G3bp1P97855 465 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Clul1Q3ZRW6 464 aa27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sv2bQ8BG39 683 aa27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Epc2Q8C0I4 808 aa27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 MsraQ9D6Y7 233 aa27.31■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trim34bJ3QNR8 485 aa27.3■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp2d11P24457 504 aa27.3■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Secisbp2lQ6A098 1086 aaKnown RBP27.3■■□□□ 1.96
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam213aQ9CYH2 218 aa27.3■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sytl4Q9R0Q1 673 aa27.3■■□□□ 1.96
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plekhm2Q80TQ5 1018 aa27.29■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc14a2Q8R4T9 930 aa27.29■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 IntuQ059U7 942 aa27.28■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trpv1Q704Y3 839 aa27.28■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppm1mQ8BU27 406 aa27.28■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Stard3nlQ9DCI3 235 aa27.28■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ehd4Q9EQP2 541 aa27.28■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Usp17lbE9Q9U0 468 aa27.27■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ddx31Q6NZQ2 687 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Echdc1Q9D9V3 322 aa27.27■■□□□ 1.96
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tfcp2l1Q3UNW5 479 aa27.26■■□□□ 1.95
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Map3k2Q61083 619 aa27.26■■□□□ 1.95
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 LdhdQ7TNG8 484 aa27.26■■□□□ 1.95
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lrch3Q8BVU0 778 aa27.26■■□□□ 1.95
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Zbtb12Q9Z150 459 aa27.26■■□□□ 1.95
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Grm1P97772 1199 aa27.25■■□□□ 1.95
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aplp1Q03157 653 aa27.25■■□□□ 1.95
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kbtbd13Q8C828 458 aa27.25■■□□□ 1.95
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bcs1lQ9CZP5 418 aa27.25■■□□□ 1.95
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Trappc6b-207ENSMUST00000218686 H2-Q4Q8HWB2 354 aa27.24■■□□□ 1.95
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