RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589050.1

RPRD1A-208, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1A, human

TSL 1 (best)

Gene RPRD1A, Length 1,022 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR5H1	A6NKK0	313 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050		E9PQ18	207 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TLX2	O43763	284 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	GYPB	P06028	91 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CLU	P10909	449 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SPI1	P17947	270 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	IGFBP2	P18065	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	LAP3	P28838	519 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PYCR1	P32322	319 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CAPZA2	P47755	286 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CXXC5	Q7LFL8	322 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	P2RY8	Q86VZ1	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CPO	Q8IVL8	374 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR52N5	Q8NH56	324 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TMEM163	Q8TC26	289 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CYGB	Q8WWM9	190 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	HSD17B8	Q92506	261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ZC3HAV1L	Q96H79	300 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	BOD1	Q96IK1	185 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PITX2	Q99697	317 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	HCAR1	Q9BXC0	346 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SH3D21	A4FU49	640 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SLC16A6	O15403	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	FARS2	O95363	451 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	GPANK1	O95872	356 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	NPR2	P20594	1047 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	KIR2DL3	P43628	341 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	GLO1	Q04760	184 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PPA1	Q15181	289 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TAB1	Q15750	504 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	NRN1L	Q496H8	165 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	C22orf34	Q6ZV56	151 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SKA3	Q8IX90	412 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	DMRTC2	Q8IXT2	367 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	WDR31	Q8NA23	367 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR51L1	Q8NGJ5	315 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PTP4A1	Q93096	173 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	NABP1	Q96AH0	204 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SH3GL3	Q99963	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR51V1	Q9H2C8	321 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SIAE	Q9HAT2	523 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	AMDHD2	Q9Y303	409 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ARPC4-TTLL3	A0A0A6YYG9	625 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	MPZL1	O95297	269 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	WNT11	O96014	354 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	HLA-DQA2	P01906	255 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SCG5	P05408	212 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	THBD	P07204	575 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CD79A	P11912	226 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	MSR1	P21757	451 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	AQP4	P55087	323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TUBA1B	P68363	451 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TUBA4A	P68366	448 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	EFNB1	P98172	346 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	KEAP1	Q14145	624 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	KLHL12	Q53G59	568 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TTC23	Q5W5X9	447 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	TUBA1A	Q71U36	451 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SLC16A14	Q7RTX9	510 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ZSCAN2	Q7Z7L9	614 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	WFDC8	Q8IUA0	241 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	BBS1	Q8NFJ9	593 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OR6K6	Q8NGW6	343 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ZNRF4	Q8WWF5	429 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	ADI1	Q9BV57	179 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	EMC7	Q9NPA0	242 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050	SLC25A15	Q9Y619	301 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RPRD1A-208	ENST00000589050		H0YJX3	145 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPRD1A-208	ENST00000589050	HLA-H	P01893	362 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPRD1A-208	ENST00000589050	GAA	P10253	952 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPRD1A-208	ENST00000589050	VHL	P40337	213 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPRD1A-208	ENST00000589050	RPS7	P62081	194 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPRD1A-208	ENST00000589050	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RPRD1A-208	ENST00000589050	HSF2	Q03933	536 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RPRD1A-208	ENST00000589050	MEP1B	Q16820	701 aa		13.52	□□□□□ -0.25

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