RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477234.1

SBF1-208, Transcript of SET binding factor 1, human

TSL 5

Gene SBF1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SBF1-208	ENST00000477234	PACRGL	Q8N7B6	248 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	SYT14	Q8NB59	555 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ICA1L	Q8NDH6	482 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	DNAJC9	Q8WXX5	260 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	BOD1	Q96IK1	185 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	DHRS1	Q96LJ7	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	SLC38A2	Q96QD8	506 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	OR5B2	Q96R09	309 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	NPAS1	Q99742	590 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ICAM5	Q9UMF0	924 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	LYVE1	Q9Y5Y7	322 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234		A0A0B4J2E0	115 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234		A0A0G2JMP0	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234		A0A0X1KG70	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234		A0A1B0GX12	115 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234		A0A1W2PNR3	127 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234		G3V2T6	193 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	DIRAS1	O95057	198 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	IGHV3-9	P01782	118 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ANXA8	P13928	327 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	PRKCA	P17252	672 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	GATA3	P23771	443 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	MPG	P29372	298 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	RBM34	P42696	430 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	DIO1	P49895	249 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	SLC16A1	P53985	500 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	TMEM33	P57088	247 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	UBA52	P62987	128 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	PIN1	Q13526	163 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ADIPOQ	Q15848	244 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	FGD3	Q5JSP0	725 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ABLIM2	Q6H8Q1	611 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	CBLN3	Q6UW01	205 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	COMTD1	Q86VU5	262 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	CDK20	Q8IZL9	346 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	RNF113B	Q8IZP6	322 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	CADM2	Q8N3J6	435 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	WDR31	Q8NA23	367 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	NUP37	Q8NFH4	326 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	RNF217	Q8TC41	542 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	GPR119	Q8TDV5	335 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	GIPC3	Q8TF64	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	RSPO3	Q9BXY4	272 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ACER3	Q9NUN7	267 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	SLC7A7	Q9UM01	511 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234		A0A1B0GWA3	101 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234		J3KTA2	159 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	PDLIM1	O00151	329 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	FFAR1	O14842	300 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	EFNA2	O43921	213 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	RGS9	O75916	674 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	CCNB2	O95067	398 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	HPR	P00739	348 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ITGA5	P08648	1049 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	PRG2	P13727	222 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	CDH2	P19022	906 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	NPR2	P20594	1047 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	CXCR1	P25024	350 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	HTR2A	P28223	471 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	VHL	P40337	213 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	CLK1	P49759	484 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	POLR2H	P52434	150 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	UBE2N	P61088	152 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	HOXC5	Q00444	222 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	PLAUR	Q03405	335 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	QPRT	Q15274	297 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	MICA	Q29983	383 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	RFX4	Q33E94	735 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	TTC33	Q6PID6	262 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	ZNF730	Q6ZMV8	503 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	GRINA	Q7Z429	371 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SBF1-208	ENST00000477234	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71

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