RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SGTBQ96EQ0 304 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INIPQ9NRY2 104 aa22.46■■□□□ 1.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CENPBD1B2RD01 187 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRASO14807 208 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPPAP01160 153 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFNA14P01570 189 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NAT2P11245 290 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCL2P13500 99 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACHEP22303 614 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AQP2P41181 271 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DAP3P51398 398 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SELENOVP59797 346 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NKPD1Q17RQ9 610 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TBC1D28Q2M2D7 210 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SEPHS2Q99611 448 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C19orf24Q9BVV8 132 aa22.45■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BBIP1A8MTZ0 92 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRMUO75648 421 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGF2P01344 180 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ACADSP16219 412 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SRP14P37108 136 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLP2Q04941 152 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLF10Q13118 480 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALKBH6Q3KRA9 238 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1J2Q8NGS2 313 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRMDAQ9H2I8 198 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR51B6Q9H340 312 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C20orf141Q9NUB4 165 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TAAR3PQ9P1P4 343 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPR160Q9UJ42 338 aa22.44■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNAP29O95721 258 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LCKP06239 509 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR1E2P47887 323 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLF3P57682 345 aaPredicted RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAPRE2Q15555 327 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC18Q8N456 261 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYNPRQ8TBG9 265 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf82Q8WW14 230 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIPHQ8WWY8 451 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF583Q96ND8 569 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MED31Q9Y3C7 131 aa22.43■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 B4DSR2 109 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MGRN1O60291 552 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCR1O76036 304 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLPTM1O96005 669 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 THRBP10828 461 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCMT1P22061 227 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD52P43351 418 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARFIP2P53365 341 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM33P57088 247 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CYBRD1Q53TN4 286 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C10orf128Q5T292 105 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LIPNQ5VXI9 398 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MOSPD2Q8NHP6 518 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLDND2Q8NHS1 167 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF519Q8TB69 540 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf40Q8WZ69 217 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YIPF5Q969M3 257 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BCL2L14Q9BZR8 327 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KCNN2Q9H2S1 579 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NARFLQ9H6Q4 476 aa22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF275Q9NSD4 429 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPAN19P0C672 248 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAGP10523 405 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF250P15622 560 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UCP2P55851 309 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSF2Q03933 536 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARMC4Q5T2S8 1044 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SNX33Q8WV41 574 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF416Q9BWM5 594 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RACGAP1Q9H0H5 632 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIAEQ9HAT2 523 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAR1AQ9NR31 198 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GID8Q9NWU2 228 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLCO1C1Q9NYB5 712 aa22.41■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPB13A6NJU9 1138 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C17orf100A8MU93 164 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPB4C9JG80 1138 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPIHO43447 177 aaKnown RBP22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SASH3O75995 380 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC2A10O95528 541 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDELR2P33947 212 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 APLNRP35414 380 aa22.4■■□□□ 1.18
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGEB1P43366 347 aa22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 105.1 ms