RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590301.1

NPC1-208, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 2

Gene NPC1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-208	ENST00000590301	LMX1B	O60663	402 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SERPINI2	O75830	405 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SEC14L2	O76054	403 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	LY6H	O94772	140 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	STAMBP	O95630	424 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	CH25H	O95992	272 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	BCL10	O95999	233 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	IGHG1	P01857	330 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	MT-ND1	P03886	318 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	THY1	P04216	161 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SERPINA5	P05154	406 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	TACSTD2	P09758	323 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	ASAH2B	P0C7U1	165 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	OR8G3P	P0DMU2	310 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	UMPS	P11172	480 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF35	P13682	527 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	DAO	P14920	347 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	GIPR	P48546	466 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	DAP3	P51398	398 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF84	P51523	738 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	CHN2	P52757	468 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SELENOV	P59797	346 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	RAB1A	P62820	205 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	GGTLC2	Q14390	218 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	CARTPT	Q16568	116 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	FXN	Q16595	210 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SLC36A2	Q495M3	483 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	MMEL1	Q495T6	779 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	PHYHD1	Q5SRE7	291 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM53	Q6P2H8	277 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	MYPOP	Q86VE0	399 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	LSR	Q86X29	649 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SVOPL	Q8N434	492 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	VANGL1	Q8TAA9	524 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	LIPH	Q8WWY8	451 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	LRRC58	Q96CX6	371 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF75A	Q96N20	296 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SEPHS2	Q99611	448 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM120A	Q9BXJ8	343 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SEC61A2	Q9H9S3	476 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM38B	Q9NVV0	291 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	GPR160	Q9UJ42	338 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	ZNF346	Q9UL40	294 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		6.56	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM129	A0AVI4	362 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	RNF212B	A8MTL3	300 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	C11orf98	E9PRG8	122 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	FXYD1	O00168	92 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	KPNA4	O00629	521 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	PEX14	O75381	377 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	OR7A10	O76100	309 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SNAP29	O95721	258 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	PGA4	P0DJD7	388 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	PGA3	P0DJD8	388 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	PCMT1	P22061	227 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	ARFIP2	P53365	341 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	CRYBA2	P53672	197 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	CLRN1	P58418	232 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	TAS2R41	P59536	307 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	PLP2	Q04941	152 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	PIGF	Q07326	219 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	KLF10	Q13118	480 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	TAF11	Q15544	211 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	MOG	Q16653	247 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	HIST3H3	Q16695	136 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	RABL3	Q5HYI8	236 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	KRT80	Q6KB66	452 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	CGB2	Q6NT52	195 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	ARPIN	Q7Z6K5	226 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	CARM1	Q86X55	608 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	RBM45	Q8IUH3	476 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	CDK20	Q8IZL9	346 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	OR4D11	Q8NGI4	311 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	FNDC8	Q8TC99	324 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	UBASH3B	Q8TF42	649 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	TMEM239	Q8WW34	195 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	LZIC	Q8WZA0	190 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	MSI2	Q96DH6	328 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	SGTB	Q96EQ0	304 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	MRPL13	Q9BYD1	178 aa	Known RBP	6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		6.55	□□□□□ -1.36
NPC1-208	ENST00000590301	LRMDA	Q9H2I8	198 aa		6.55	□□□□□ -1.36

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