RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	GPR35	Q9HC97	309 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RCE1	Q9Y256	329 aa		9.26	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	AGAP5	A6NIR3	686 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511		M0R3G1	203 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	FAAH	O00519	579 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB36	O95755	333 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	DBI	P07108	87 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	TFPT	P0C1Z6	253 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	GKN3P	P0CG01	181 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	NR2F1	P10589	423 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT4	P19013	534 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	GLRX	P35754	106 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN8	P56748	225 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PCLAF	Q15004	111 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SYPL1	Q16563	259 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	UGT3A2	Q3SY77	523 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	XKR7	Q5GH72	579 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA8L1	Q5VT79	327 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CARD17	Q5XLA6	110 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SPATC1	Q76KD6	591 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	LRP11	Q86VZ4	500 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SIGLECL1	Q8N7X8	197 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ANKFN1	Q8N957	763 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX33	Q8WV41	574 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	TIMD4	Q96H15	378 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	C3orf30	Q96M34	536 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF385D	Q9H6B1	395 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	FBXL7	Q9UJT9	491 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		9.25	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A096LPI6	279 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF99	A8MXY4	864 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CLDN25	C9JDP6	229 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	NCR1	O76036	304 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	NUDT17	P0C025	328 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PNMT	P11086	282 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	GATA3	P23771	443 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MAGEB1	P43366	347 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	P2RY4	P51582	365 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CCL8	P80075	99 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	WHAMMP3	Q1A5X7	153 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	AP1AR	Q63HQ0	302 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SAXO2	Q658L1	398 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	STEAP3	Q658P3	488 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	LRRC74B	Q6ZQY2	392 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RNF130	Q86XS8	419 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MNS1	Q8NEH6	495 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	NEURL3	Q96EH8	262 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	GAL3ST1	Q99999	423 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC38A1	Q9H2H9	487 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MTHFD2L	Q9H903	347 aa	Predicted RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	B3GAT2	Q9NPZ5	323 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RLIM	Q9NVW2	624 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MED29	Q9NX70	200 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZDHHC2	Q9UIJ5	367 aa		9.24	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ISPD	A4D126	451 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	HMGN4	O00479	90 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RP2	O75695	350 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PRTN3	P24158	256 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ALDH3A1	P30838	453 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RPS5	P46782	204 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	IL13RA1	P78552	427 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	EMX2	Q04743	252 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	BAMBI	Q13145	260 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	CHI3L2	Q15782	390 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	LIN52	Q52LA3	116 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RGS7BP	Q6MZT1	257 aa	Predicted RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SNX32	Q86XE0	403 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB1C	Q92928	201 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	OXGR1	Q96P68	337 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	GPA33	Q99795	319 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	DECR2	Q9NUI1	292 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		9.23	□□□□□ -0.93
SKAP2-209	ENST00000497511	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		9.23	□□□□□ -0.93

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