RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 SSPNQ14714 243 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC22A16Q86VW1 577 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PLCZ1Q86YW0 608 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ASB10Q8WXI3 467 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CDC6Q99741 560 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC32Q9BV29 185 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PROK2Q9HC23 129 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXJ2Q9P0K8 574 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 LAMP5Q9UJQ1 280 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PFDN1O60925 122 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ABHD16AO95870 558 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SERPINA3P01011 423 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PSKH1P11801 424 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CTLA4P16410 223 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ALOX5APP20292 161 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CFL1P23528 166 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C19orf57Q0VDD7 668 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 Q0VFX4 171 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF79Q15937 498 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C3orf33Q6P1S2 294 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 DPY19L4Q7Z388 723 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 EGFL6Q8IUX8 553 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM156Q8N614 296 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PAQR8Q8TEZ7 354 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 COMMD3Q9UBI1 195 aa15.48■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC187A0A096LP49 1063 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NPIPB13A6NJU9 1138 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NPIPB4C9JG80 1138 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 UPK3AO75631 287 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TACSTD2P09758 323 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 IFNGR1P15260 489 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 MYL9P24844 172 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PPP3R1P63098 170 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CHAF1BQ13112 559 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZMAT1Q5H9K5 638 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TPRA1Q86W33 373 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 WDFY1Q8IWB7 410 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 DIRAS2Q96HU8 199 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM185BQ9H7F4 350 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 B3GALT5Q9Y2C3 310 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 A6NIZ1 184 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NPIPA5E9PKD4 350 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 HPP00738 406 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 OPN1LWP04000 364 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ICAM2P13598 275 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ADH6P28332 368 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 EIF1P41567 113 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RPS27P42677 84 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 DAP3P51398 398 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RAP1BP61224 184 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 RAP1AP62834 184 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 HSF1Q00613 529 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ETFDHQ16134 617 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 PAMR1Q6UXH9 720 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM220AQ7Z4H9 259 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 YIPF7Q8N8F6 280 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C5orf34Q96MH7 638 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FOXN4Q96NZ1 517 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SRRQ9GZT4 340 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FANCFQ9NPI8 374 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 HPF1Q9NWY4 346 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 NPIPA1Q9UND3 350 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa15.47■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 GPRIN2O60269 458 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 KRT8P05787 483 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 CENPAP49450 140 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 BLVRAP53004 296 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 EGR3Q06889 387 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SPEM2Q0P670 501 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 LIPNQ5VXI9 398 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC22A10Q63ZE4 541 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 HBMQ6B0K9 141 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC35D2Q76EJ3 337 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 OTOSQ8NHW6 89 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ZBTB8AQ96BR9 441 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 C14orf119Q9NWQ9 140 aa15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
RABGGTA-201ENST00000216840 FREM3P0C091 2139 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 CFAP54Q96N23 3096 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A087WZY1 265 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 A0A0G2JK05 382 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 SNPHO15079 494 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 HPGDSO60760 199 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 RPP14O95059 124 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 HLA-DQA2P01906 255 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 OR10A3P58181 314 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 RPS15P62841 145 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 SELENBP1Q13228 472 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 OTPQ5XKR4 325 aa15.45■□□□□ 0.06
RABGGTA-201ENST00000216840 MZT2AQ6P582 158 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms