RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	NQO1	P15559	274 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	PCMT1	P22061	227 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKAR1B	P31321	381 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	LMO4	P61968	165 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ACTG1	P63261	375 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	CAMK2D	Q13557	499 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC2A7	Q6PXP3	512 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT2A3	Q6UWM9	527 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MSANTD1	Q6ZTZ1	278 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MSRB3	Q8IXL7	192 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF2H4	Q92759	462 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	RDH5	Q92781	318 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	CENPH	Q9H3R5	247 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	CACYBP	Q9HB71	228 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNK9	Q9NPC2	374 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	THUMPD1	Q9NXG2	353 aa	Known RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC25A37	Q9NYZ2	338 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	NOL12	Q9UGY1	213 aa	Known RBP eCLIP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338		V9GYY5	206 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM247	A6NEH6	219 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	CLIC1	O00299	241 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TPST2	O60704	377 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SERPINI2	O75830	405 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TF	P02787	698 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ARAF	P10398	606 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ETS2	P15036	469 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	EGR1	P18146	543 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEB1	P43366	347 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB1A	P62820	205 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	PUDP	Q08623	228 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	FADD	Q13158	208 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB39A	Q14964	217 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ALKBH6	Q3KRA9	238 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR93	Q6P2C0	686 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SHQ1	Q6PI26	577 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SCAI	Q8N9R8	606 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	OR51F2	Q8NH61	342 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	NFKBID	Q8NI38	313 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	LRR1	Q96L50	414 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	FOXB1	Q99853	325 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MS4A5	Q9H3V2	200 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	RMND5A	Q9H871	391 aa		10.22	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC105371242	A0A075B767	164 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0B4J2E0	115 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1B0GX12	115 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PPW3	197 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB36	O95755	333 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	CLPTM1	O96005	669 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	EPHA1	P21709	976 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	HILS1	P60008	231 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GALK2	Q01415	458 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	AVPI1	Q5T686	147 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	HHAT	Q5VTY9	493 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM91A1	Q658Y4	838 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ULK3	Q6PHR2	472 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	DHRS4L2	Q6PKH6	230 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR88	Q6ZMY6	472 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	NET1	Q7Z628	596 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SKA3	Q8IX90	412 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GTF3A	Q92664	365 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	IKZF5	Q9H5V7	419 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	G6PC2	Q9NQR9	355 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	THAP1	Q9NVV9	213 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MRPL39	Q9NYK5	338 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	DUSP13	Q9UII6	198 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	POFUT2	Q9Y2G5	429 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GRIP1	Q9Y3R0	1128 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		10.21	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TANC2	Q9HCD6	1990 aa		10.21	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM120B	A0PK00	339 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM89	A2RUT3	159 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	C5orf58	C9J3I9	102 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	PLPP3	O14495	311 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	KCNAB3	O43448	404 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC14B	O60729	498 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	UBL3	O95164	117 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	PNP	P00491	289 aa		10.2	□□□□□ -0.78
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM157B	P0CG42	384 aa		10.2	□□□□□ -0.78

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