RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 MED29Q9NX70 200 aa10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 ING1Q9UK53 422 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 POFUT2Q9Y2G5 429 aa10.24□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 TRAV36DV7A0A075B6V5 113 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 OR2M5A3KFT3 312 aa10.23□□□□□ -0.77
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CAPNS1-209ENST00000590049 OR2T1O43869 369 aa10.23□□□□□ -0.77
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CAPNS1-209ENST00000590049 MED18Q9BUE0 208 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF426Q9BUY5 554 aa10.23□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 DGCR6LQ9BY27 220 aa10.23□□□□□ -0.77
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CAPNS1-209ENST00000590049 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
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CAPNS1-209ENST00000590049 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 B4DXG7 233 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BN98 237 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 HS3ST1O14792 307 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 ZIC3O60481 467 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 HCN1O60741 890 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 NTN1O95631 604 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 CH25HO95992 272 aa10.22□□□□□ -0.77
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CAPNS1-209ENST00000590049 C1orf140Q5VVS0 124 aa10.22□□□□□ -0.77
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CAPNS1-209ENST00000590049 IZUMO2Q6UXV1 221 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 CHMP1BQ7LBR1 199 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF555Q8NEP9 628 aa10.22□□□□□ -0.77
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CAPNS1-209ENST00000590049 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 SPRR3Q9UBC9 169 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 AP4B1Q9Y6B7 739 aa10.22□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 UNC119BA6NIH7 251 aa10.21□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 AHRRA9YTQ3 701 aa10.21□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 SEC14L5O43304 696 aa10.21□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 OR7A10O76100 309 aa10.21□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 OR6A2O95222 327 aa10.21□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 ACTL6AO96019 429 aa10.21□□□□□ -0.77
CAPNS1-209ENST00000590049 ALPLP05186 524 aa10.21□□□□□ -0.77
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