RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, humanhuman

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1-208ENST00000586667 TSSK6Q9BXA6 273 aa11.15□□□□□ -0.62
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DNMT1-208ENST00000586667 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
DNMT1-208ENST00000586667 GRIP2Q9C0E4 1043 aa11.15□□□□□ -0.62
DNMT1-208ENST00000586667 TOR3AQ9H497 397 aa11.15□□□□□ -0.62
DNMT1-208ENST00000586667 C8orf4Q9NR00 106 aa11.15□□□□□ -0.62
DNMT1-208ENST00000586667 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
DNMT1-208ENST00000586667 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
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DNMT1-208ENST00000586667 M0R129 80 aa11.14□□□□□ -0.63
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DNMT1-208ENST00000586667 CASP12Q6UXS9 341 aa11.14□□□□□ -0.63
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DNMT1-208ENST00000586667 HIST3H3Q16695 136 aa11.13□□□□□ -0.63
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DNMT1-208ENST00000586667 COL12A1Q99715 3063 aa11.13□□□□□ -0.63
DNMT1-208ENST00000586667 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
DNMT1-208ENST00000586667 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
DNMT1-208ENST00000586667 CACNA1CQ13936 2221 aa11.12□□□□□ -0.63
DNMT1-208ENST00000586667 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa11.12□□□□□ -0.63
DNMT1-208ENST00000586667 A0A1B0GUH1 482 aa11.12□□□□□ -0.63
DNMT1-208ENST00000586667 CLEC18AA5D8T8 446 aa11.12□□□□□ -0.63
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