RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	C20orf196	Q8IYI0	205 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	YIPF5	Q969M3	257 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	EMC6	Q9BV81	110 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	FZR1	Q9UM11	496 aa		10.26	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MS4A18	H0YCH9	400 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	HDAC3	O15379	428 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC22A3	O75751	556 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ANP32D	O95626	131 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	IL6	P05231	212 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	CD79A	P11912	226 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	FXN	Q16595	210 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GSG1	Q2KHT4	349 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF813	Q6ZN06	617 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	C1orf229	Q6ZS94	237 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MAVS	Q7Z434	540 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	C10orf111	Q8N326	155 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	IL17RD	Q8NFM7	739 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC38A4	Q969I6	547 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC35B4	Q969S0	331 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM186	Q96B77	213 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TXNDC15	Q96J42	360 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	BCL2L10	Q9HD36	194 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	A4GALT	Q9NPC4	353 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MED29	Q9NX70	200 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TREM2	Q9NZC2	230 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	REV1	Q9UBZ9	1251 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF232	Q9UNY5	417 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	IFT52	Q9Y366	437 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		10.25	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TRAV36DV7	A0A075B6V5	113 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A087WUJ7	227 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	VSTM5	A8MXK1	200 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRN3	E7EW58	273 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	RP2	O75695	350 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	BGLAP	P02818	100 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MSMB	P08118	114 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GAA	P10253	952 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	KIT	P10721	976 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	BMP2	P12643	396 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	IDO1	P14902	403 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ACHE	P22303	614 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GLRX	P35754	106 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR6	P46095	362 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	GIPR	P48546	466 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	EVX1	P49640	407 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	WDR4	P57081	412 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	RGN	Q15493	299 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC9B1	Q4ZJI4	515 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ALG10B	Q5I7T1	473 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	C6orf10	Q5SRN2	563 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	NXN	Q6DKJ4	435 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	THSD4	Q6ZMP0	1018 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF627	Q7L945	461 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF584	Q8IVC4	421 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	UEVLD	Q8IX04	471 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MREG	Q8N565	214 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	LSMEM1	Q8N8F7	131 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	BBS10	Q8TAM1	723 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ITCH	Q96J02	903 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MAEL	Q96JY0	434 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	OR52B2	Q96RD2	323 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	WFDC6	Q9BQY6	131 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	PAIP1	Q9H074	479 aa	Known RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ARMC7	Q9H6L4	198 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	C12orf10	Q9HB07	376 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SDR39U1	Q9NRG7	319 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF275	Q9NSD4	429 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		10.24	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0A6YYJ9	748 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TRPC5OS	A6NMA1	111 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	OR2T1	O43869	369 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	TPST1	O60507	370 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	AVP	P01185	164 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	PATE4	P0C8F1	98 aa		10.23	□□□□□ -0.77
TTLL3-233	ENST00000602338	NAT2	P11245	290 aa		10.23	□□□□□ -0.77

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