RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577598.5

BRIP1-202, Transcript of BRCA1 interacting protein C-terminal helicase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene BRIP1, Length 3,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1-202ENST00000577598 RAB4AP20338 218 aa4.6□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 LMO1P25800 156 aa4.6□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 HOXA9P31269 272 aa4.6□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 ACOT2P49753 483 aa4.6□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 EMP2P54851 167 aa4.6□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 GABPAQ06546 454 aa4.6□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 ZBED5Q49AG3 693 aa4.6□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 DCST2Q5T1A1 773 aa4.6□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 TMEM207Q6UWW9 146 aa4.6□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa4.6□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 TAC4Q86UU9 113 aa4.6□□□□□ -1.67
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BRIP1-202ENST00000577598 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP4.59□□□□□ -1.67
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BRIP1-202ENST00000577598 RFC3P40938 356 aa4.59□□□□□ -1.67
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BRIP1-202ENST00000577598 CDNFQ49AH0 187 aa4.59□□□□□ -1.67
BRIP1-202ENST00000577598 PRR27Q6MZM9 219 aa4.59□□□□□ -1.67
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BRIP1-202ENST00000577598 SLC39A11Q8N1S5 342 aa4.59□□□□□ -1.67
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