RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516122.1

RNU6-871P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 871, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-871P, Length 100 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-871P-201ENST00000516122 IL37Q9NZH6 218 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 ANAPC2Q9UJX6 822 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CDH7Q9ULB5 785 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 IKBKGQ9Y6K9 419 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 STARD9Q9P2P6 4700 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 FREM1Q5H8C1 2179 aa-2.29□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GVC2 190 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAGEB16A2A368 324 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 C12orf77C9JDV5 145 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PTGES3LE9PB15 166 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 TM7SF2O76062 418 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 HLA-DPB1P04440 258 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 APRTP07741 180 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 ETS2P15036 469 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 HPGDP15428 266 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTRB1P17538 263 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 AQP2P41181 271 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF92Q03936 586 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPRL3Q12980 569 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 ARL6IP1Q15041 203 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PON2Q15165 354 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBE2V2Q15819 145 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PHYHD1Q5SRE7 291 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 DNAJC24Q6P3W2 148 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 LEG1Q6P5S2 330 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 BTNL3Q6UXE8 466 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 Q6ZTI0 123 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 HOMEZQ8IX15 550 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CMTM5Q96DZ9 223 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 ITCHQ96J02 903 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 ZNF558Q96NG5 402 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATG101Q9BSB4 218 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC106Q9BWC9 280 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CTNNA3Q9UI47 895 aa-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP-2.3□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A087X0K7 114 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BNH8 94 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PLIN1O60240 522 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 GKN3PP0CG01 181 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 SERPINA2P20848 420 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSMA3P25788 255 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 HLA-DMAP28067 261 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCR7P32248 378 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 NPBWR2P48146 333 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 TAS2R31P59538 309 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 RUNX1Q01196 453 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 TSPY1Q01534 308 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 FAM131AQ6UXB0 335 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 C1orf186Q6ZWK4 172 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 H2AFVQ71UI9 128 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 LHFPL3Q86UP9 236 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 LINC00469Q8N7U9 141 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC2A14Q8TDB8 520 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 SPACA4Q8TDM5 124 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 FUNDC2Q9BWH2 189 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 NLNQ9BYT8 704 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 RRN3Q9NYV6 651 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 GALPQ9UBC7 116 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 VAX2Q9UIW0 290 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 SLC7A11Q9UPY5 501 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 GMPPBQ9Y5P6 360 aa-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-2.31□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 A0A1B0GU33 70 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 A8MXQ7 604 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 H3BMH7 237 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 SH3BP5O60239 455 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 OR7C2O60412 319 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 JAK2O60674 1132 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PYGLP06737 847 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 VIMP08670 466 aaKnown RBP-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CSF3P09919 207 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CCDC130P13994 396 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CHMLP26374 656 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 GCH1P30793 250 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 COILP38432 576 aaPredicted RBP-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 FRKP42685 505 aaPredicted RBP-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 GNPDA1P46926 289 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 ATP1B3P54709 279 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 CRADDP78560 199 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PSG4Q00888 419 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 PON3Q15166 354 aa-2.32□□□□□ -2.78
RNU6-871P-201ENST00000516122 STXBP2Q15833 593 aa-2.32□□□□□ -2.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms