RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293441.5

SHANK1-201, Transcript of SH3 and multiple ankyrin repeat domains 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SHANK1, Length 6,643 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK1-201ENST00000293441 RAB40AQ8WXH6 277 aa15.95■□□□□ 0.14
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SHANK1-201ENST00000293441 PIGLQ9Y2B2 252 aa15.93■□□□□ 0.14
SHANK1-201ENST00000293441 BEX5Q5H9J7 111 aa15.93■□□□□ 0.14
SHANK1-201ENST00000293441 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa15.93■□□□□ 0.14
SHANK1-201ENST00000293441 GPR171O14626 319 aa15.92■□□□□ 0.14
SHANK1-201ENST00000293441 TPT1P13693 172 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
SHANK1-201ENST00000293441 NXNL2Q5VZ03 156 aa15.92■□□□□ 0.14
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