RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416651.5

NIF3L1-206, Transcript of NGG1 interacting factor 3 like 1, human

TSL 2 BASIC

Gene NIF3L1, Length 967 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NIF3L1-206	ENST00000416651	CRYBB2	P43320	205 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CAPZA2	P47755	286 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	EVX1	P49640	407 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	AQP5	P55064	265 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPS11	P82912	194 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GUCY2D	Q02846	1103 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GLO1	Q04760	184 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CEACAM7	Q14002	265 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR68	Q15743	365 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	METTL2B	Q6P1Q9	378 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CLEC4F	Q8N1N0	589 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PARP8	Q8N3A8	854 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ACTRT1	Q8TDG2	376 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OSBPL9	Q96SU4	736 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SDF2	Q99470	211 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GAL3ST1	Q99999	423 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TOR3A	Q9H497	397 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPATCH2	Q9NW75	528 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SIRT5	Q9NXA8	310 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF224	Q9NZL3	707 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SEC14L4	Q9UDX3	406 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	MKLN1	Q9UL63	735 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	HDGFL3	Q9Y3E1	203 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		7.26	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMED7-TICAM2	A0A0A6YYA0	188 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAV40	A0A0B4J280	105 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	IGHV1-69-2	A0A0G2JMI3	117 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1B0GUS0	222 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651		A0A1W2PPW3	197 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ISPD	A4D126	451 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	C17orf100	A8MU93	164 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SRRM5	B3KS81	715 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651		H3BNH8	94 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651		K7EIL1	84 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SHOX2	O60902	331 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PLAT	P00750	562 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CSTA	P01040	98 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT6A	P02538	564 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	C1QC	P02747	245 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT6B	P04259	564 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CSF1	P09603	554 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	THRB	P10828	461 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCL2	P13500	99 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF14	P17017	642 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	HMOX2	P30519	316 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GLRX	P35754	106 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PGM1	P36871	562 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	APOBEC1	P41238	236 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	KRT6C	P48668	564 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC35A1	P78382	337 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	BNIP2	Q12982	314 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	KIAA0040	Q15053	153 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR7A5	Q15622	319 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	EMB	Q6PCB8	327 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CREB3L2	Q70SY1	520 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	MRPL41	Q8IXM3	137 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	LYG1	Q8N1E2	194 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OR52E2	Q8NGJ4	325 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF563	Q8TA94	476 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SLC25A43	Q8WUT9	341 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TSSK3	Q96PN8	268 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMEM237	Q96Q45	408 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	DCLRE1C	Q96SD1	692 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	DPH5	Q9H2P9	285 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GPR35	Q9HC97	309 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZCCHC3	Q9NUD5	404 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SH3BP4	Q9P0V3	963 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	RCE1	Q9Y256	329 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TRAPPC4	Q9Y296	219 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TMED7	Q9Y3B3	224 aa		7.25	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	CCDC189	A1A4V9	331 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	VSTM5	A8MXK1	200 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	FRS3	O43559	492 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SMIM24	O75264	130 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	SUPT7L	O94864	414 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	IFI6	P09912	130 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	GATA3	P23771	443 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TYK2	P29597	1187 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	IDH2	P48735	452 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	DR1	Q01658	176 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAX2	Q02962	417 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	PAX8	Q06710	450 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	TP53BP2	Q13625	1128 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	UAP1	Q16222	522 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		7.24	□□□□□ -1.25
NIF3L1-206	ENST00000416651	ZNF362	Q5T0B9	420 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25

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