RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586667.1

DNMT1-208, Transcript of DNA methyltransferase 1, human

TSL 2

Gene DNMT1, Length 714 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DNMT1-208	ENST00000586667	UNC119B	A6NIH7	251 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667		G3V2T6	193 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PRRG2	O14669	202 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	EI24	O14681	340 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	EIF1B	O60739	113 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MITF	O75030	526 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PTP4A3	O75365	173 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	BAG2	O95816	211 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ALPL	P05186	524 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	IGFBP1	P08833	259 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GLI4	P10075	376 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SAG	P10523	405 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	POU2F1	P14859	743 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GABRA1	P14867	456 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	AQP2	P41181	271 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC9A3	P48764	834 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RBPJ	Q06330	500 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	RPL18	Q07020	188 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC17A1	Q14916	467 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	POU4F3	Q15319	338 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	KDM4D	Q6B0I6	523 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	KLHL17	Q6TDP4	642 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	H1FNT	Q75WM6	255 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FCRLA	Q7L513	359 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	STK32C	Q86UX6	486 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CBR4	Q8N4T8	237 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NAXE	Q8NCW5	288 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	FANK1	Q8TC84	345 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TRIB1	Q96RU8	372 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC29A1	Q99808	456 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CALHM2	Q9HA72	323 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TIGAR	Q9NQ88	270 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	USE1	Q9NZ43	259 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	KLHL13	Q9P2N7	655 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MGAT4B	Q9UQ53	548 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CDH10	Q9Y6N8	788 aa		11.22	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	LOC102725191	A0A1B0GVB3	256 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MCIDAS	D6RGH6	385 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MS4A18	H0YCH9	400 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	DLGAP1	O14490	977 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	HLA-DOB	P13765	273 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GNLY	P22749	145 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NTF4	P34130	210 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	IFNGR2	P38484	337 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NUP107	P57740	925 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SLC34A1	Q06495	639 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PUDP	Q08623	228 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TRIP10	Q15642	601 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MS4A18	Q3C1V0	323 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	LPCAT4	Q643R3	524 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OAF	Q86UD1	273 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	KDM8	Q8N371	416 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	PARP8	Q8N3A8	854 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	CLDN22	Q8N7P3	220 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ZIC4	Q8N9L1	334 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OR51A7	Q8NH64	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	WNT2B	Q93097	391 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TNFRSF13C	Q96RJ3	184 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	ASPN	Q9BXN1	380 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	BCO1	Q9HAY6	547 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	SH3BGRL2	Q9UJC5	107 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		11.21	□□□□□ -0.61
DNMT1-208	ENST00000586667	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	ESPL1	Q14674	2120 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667		E9PQ18	207 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	SS18L1	O75177	396 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	SOX14	O95416	240 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	SYNGR4	O95473	234 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	FCGR2A	P12318	317 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	ANXA8	P13928	327 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	EDNRA	P25101	427 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	GTF2E2	P29084	291 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	EPHA2	P29317	976 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	ZP4	Q12836	540 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	PMS2P3	Q13401	168 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	DAG1	Q14118	895 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	PDK3	Q15120	406 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	ZBED5	Q49AG3	693 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	FBXW10	Q5XX13	1052 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	RASSF6	Q6ZTQ3	369 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	RRM2B	Q7LG56	351 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	GCNT2	Q8N0V5	402 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	ATG16L2	Q8NAA4	619 aa		11.2	□□□□□ -0.62
DNMT1-208	ENST00000586667	OR9K2	Q8NGE7	335 aa		11.2	□□□□□ -0.62

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