RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216840.10

RABGGTA-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTA, Length 2,088 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-201ENST00000216840 TPK1Q9H3S4 243 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GALNT8Q9NY28 637 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 KLRF1Q9NZS2 232 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GRHPRQ9UBQ7 328 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 HRH3Q9Y5N1 445 aa15.61■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 J3QLW9 94 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GABRPO00591 440 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CTDSP2O14595 271 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SULT1C4O75897 302 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GLCEO94923 617 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 OR2T7P0C7T2 308 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 COX6A1P12074 109 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF19P17023 458 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SDC2P34741 201 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PTGDSP41222 190 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TGM4P49221 684 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 LINC01590Q5TEZ4 76 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 VASH1Q7L8A9 365 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SNX29P2Q8IUI4 249 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 OR2Y1Q8NGV0 311 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 OR2T27Q8NH04 317 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 OR11A1Q9GZK7 315 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SMURF1Q9HCE7 757 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 R4GN57 208 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.6■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SELENOFO60613 162 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CELA2AP08217 269 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GAAP10253 952 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CD59P13987 128 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CD40LGP29965 261 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 DLX5P56178 289 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SGCBQ16585 318 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 NTRK2Q16620 822 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MESTQ5EB52 335 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GPR139Q6DWJ6 353 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TMEM91Q6ZNR0 172 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 MARCH9Q86YJ5 346 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF346Q9UL40 294 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PYCR1P32322 319 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ETV6P41212 452 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 INSL4Q14641 139 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 DCAF12Q5T6F0 453 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 LYPD4Q6UWN0 246 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ARSKQ6UWY0 536 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 OR5J2Q8NH18 312 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TSSK2Q96PF2 358 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ALG12Q9BV10 488 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.59■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CD8B2A6NJW9 211 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 AHSA1O95433 338 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CD8BP10966 210 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GALP22466 123 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 GRPRP30550 384 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CAPZA2P47755 286 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 E2F1Q01094 437 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 ZNF45Q02386 682 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 RGS21Q2M5E4 152 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC157Q569K6 752 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 C5orf46Q6UWT4 87 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CCDC190Q86UF4 302 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 CHPT1Q8WUD6 406 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 TTTY10Q9BZA0 68 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 METTL7AQ9H8H3 244 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa15.58■□□□□ 0.09
RABGGTA-201ENST00000216840 KMT2EQ8IZD2 1858 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 FAM171A2A8MVW0 826 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 C11orf98E9PRG8 122 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PLPP2O43688 288 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 DXOO77932 396 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MSX1P28360 303 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TAS2R43P59537 309 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 EXT1Q16394 746 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 TP53I3Q53FA7 332 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 ARL9Q6T311 187 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 DCDC5Q6ZRR9 648 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PARP16Q8N5Y8 322 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 INIPQ9NRY2 104 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 PLEKHB1Q9UF11 243 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 COPS3Q9UNS2 423 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 MOKQ9UQ07 419 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 VDAC3Q9Y277 283 aa15.58■□□□□ 0.08
RABGGTA-201ENST00000216840 WIF1Q9Y5W5 379 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms