RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 TFPIP10646 304 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 IMPDH2P12268 514 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 DDX5P17844 614 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SRD5A1P18405 259 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CCNA2P20248 432 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 MATN1P21941 496 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ALDH3A1P30838 453 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 NR4A2P43354 598 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SLC16A1P53985 500 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SLC18A1P54219 525 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 H3F3AP84243 136 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 GGTLC2Q14390 218 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SPDYE7PQ495Y7 208 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 C6orf136Q5SQH8 315 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 HHATQ5VTY9 493 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 IL23RQ5VWK5 629 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL17Q6TDP4 642 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 C6orf120Q7Z4R8 191 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ANKRD42Q8N9B4 389 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC63Q8NA47 563 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 AGR3Q8TD06 166 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 FOXN4Q96NZ1 517 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF350Q9GZX5 532 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC134Q9H6E4 229 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ASB6Q9NWX5 421 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 MOKQ9UQ07 419 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM72A0PK05 275 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 COPEO14579 308 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 AP3D1O14617 1153 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TM9SF1O15321 606 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CFLARO15519 480 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA0513O60268 411 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SCN2BO60939 215 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 KRT16P08779 473 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 OR12D1P0DN82 309 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 KRT4P19013 534 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PGCP20142 388 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 IL2RGP31785 369 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 RYKP34925 604 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SOAT1P35610 550 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CCT5P48643 541 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 GZMKP49863 264 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PDLIM4P50479 330 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 OR2B6P58173 313 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PHC1P78364 1004 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 LGALS3BPQ08380 585 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 AP1ARQ63HQ0 302 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 OR4F3Q6IEY1 312 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 FAM166AQ6J272 317 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CASP12Q6UXS9 341 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 FRRS1Q6ZNA5 592 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SSX8Q7RTT4 187 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 LINC01356Q8N9X3 169 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 MGARPQ8TDB4 240 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 RAB8BQ92930 207 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 C3orf49Q96BT1 292 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO17Q96EF6 278 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PPP3R2Q96LZ3 170 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TRMOQ9BU70 441 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 DUSP26Q9BV47 211 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 OR51I1Q9H343 314 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SEC61A2Q9H9S3 476 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SERINC1Q9NRX5 453 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 EMC3Q9P0I2 261 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SLC17A7Q9P2U7 560 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CHRNA9Q9UGM1 479 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ZDHHC2Q9UIJ5 367 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 KCNS2Q9ULS6 477 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 LRP5LA4QPB2 252 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM114B3SHH9 223 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 GPR171O14626 319 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 KLF11O14901 512 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 NPHS1O60500 1241 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 STX11O75558 287 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CHEK2O96017 543 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CSF3P09919 207 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 G6PDP11413 515 aa5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 APEHP13798 732 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 RPL3P39023 403 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 IDH2P48735 452 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 SEC24CP53992 1094 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms