RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480525.5

HDAC6-223, Transcript of histone deacetylase 6, human

TSL 3

Gene HDAC6, Length 412 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC6-223	ENST00000480525	SH3BGR	P55822	239 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RPS4X	P62701	263 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PMPCA	Q10713	525 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CEACAM7	Q14002	265 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC17A1	Q14916	467 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TRAM2	Q15035	370 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PON3	Q15166	354 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OR1Q1	Q15612	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SGCB	Q16585	318 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	C3orf36	Q3SXR2	165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ELOA3B	Q3SY89	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	C1orf140	Q5VVS0	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FAM205BP	Q63HN1	556 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GLYAT	Q6IB77	296 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NHLRC1	Q6VVB1	395 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525		Q6ZT83	130 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TMPRSS11F	Q6ZWK6	438 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FCRLA	Q7L513	359 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF627	Q7L945	461 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ABHD12B	Q7Z5M8	362 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	STK32C	Q86UX6	486 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FJX1	Q86VR8	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CYP4Z1	Q86W10	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FAM169B	Q8N8A8	192 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	C9orf106	Q8NAJ2	232 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GATS	Q8NAP1	163 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PAPD5	Q8NDF8	572 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PIK3C3	Q8NEB9	887 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ELOA3	Q8NG57	546 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	FNDC9	Q8TBE3	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ACOT11	Q8WXI4	607 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SMPDL3B	Q92485	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF524	Q96C55	264 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	INTS12	Q96CB8	462 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PYURF	Q96I23	114 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ADAD1	Q96M93	576 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NSMCE2	Q96MF7	247 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZNF300	Q96RE9	604 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GPX7	Q96SL4	187 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SEPHS2	Q99611	448 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	MCHR1	Q99705	422 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PRSS27	Q9BQR3	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PTDSS2	Q9BVG9	487 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TAPBPL	Q9BX59	468 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TRIM15	Q9C019	465 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	DENND2D	Q9H6A0	471 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SMURF2	Q9HAU4	748 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	OBP2B	Q9NPH6	170 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	KRCC1	Q9NPI7	259 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ADA2	Q9NZK5	511 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ING1	Q9UK53	422 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	A4GNT	Q9UNA3	340 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ENPP4	Q9Y6X5	453 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CAD	P27708	2225 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RAI1	Q7Z5J4	1906 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.54	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SPG11	Q96JI7	2443 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	APC	P25054	2843 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TCRBV5S2	A0A599	114 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TMEM72	A0PK05	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PDLIM1	O00151	329 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	EBAG9	O00559	213 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TNFSF11	O14788	317 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GSTA4	O15217	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GYG2	O15488	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	HNRNPR	O43390	633 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CXCL13	O43927	109 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	ZG16	O60844	167 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	CYP7B1	O75881	506 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	AQP8	O94778	261 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	UBOX5	O94941	541 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	STAMBP	O95630	424 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	TGM6	O95932	706 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	SERPINA1	P01009	418 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	IGHM	P01871	453 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	BGLAP	P02818	100 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	GKN3P	P0CG01	181 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RAP2A	P10114	183 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	IMPDH2	P12268	514 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	PRG2	P13727	222 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	AQP1	P29972	269 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	RYK	P34925	604 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	LIMS1	P48059	325 aa		4.53	□□□□□ -1.68
HDAC6-223	ENST00000480525	STAR	P49675	285 aa		4.53	□□□□□ -1.68

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