RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTDC1Q4AE62 458 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C11orf71Q6IPW1 123 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AAED1Q7RTV5 226 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAVSQ7Z434 540 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MUC15Q8N387 334 aa22.97■■□□□ 1.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZIC4Q8N9L1 334 aa22.96■■□□□ 1.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM19Q96HH6 336 aa22.96■■□□□ 1.27
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa22.95■■□□□ 1.26
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SLC25A3Q00325 362 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM225Q6GV28 225 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIER2Q8N344 545 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POMGNT2Q8NAT1 580 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 OR9I1Q8NGQ6 314 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS33AQ96AX1 596 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPATA9Q9BWV2 254 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FKRPQ9H9S5 495 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADPRHL2Q9NX46 363 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP23Q9Y6H3 246 aa22.95■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRPS1P60891 318 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF544Q6NX49 715 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLHL24Q6TFL4 600 aa22.94■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLCD1Q96CP7 247 aa22.94■■□□□ 1.26
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IFT52Q9Y366 437 aa22.94■■□□□ 1.26
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCA1O95477 2261 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FAM234BA2RU67 622 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CD5LO43866 347 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 WNT11O96014 354 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDH2P19022 906 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAB35Q15286 201 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C1orf140Q5VVS0 124 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABHD12BQ7Z5M8 362 aaPredicted RBP22.93■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHST2Q9Y4C5 530 aa22.93■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A0A096LPI6 279 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KLF11O14901 512 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FRS3O43559 492 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KRT33AO76009 404 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VAMP5O95183 116 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DSCR9P59020 149 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF311Q5JNZ3 666 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLEC2AQ6UVW9 174 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SERPINA11Q86U17 422 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GTF2H4Q92759 462 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C3orf49Q96BT1 292 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RAD21L1Q9H4I0 556 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMBIM4Q9HC24 238 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATRQ13535 2644 aa22.92■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 P2RY4P51582 365 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RGNQ15493 299 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HIKESHIQ53FT3 197 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STK35Q8TDR2 534 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YAE1D1Q9NRH1 226 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ALPK2Q86TB3 2170 aa22.91■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TMEM229AB2RXF0 380 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 H7C417 338 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLIC1O00299 241 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPIPB7O75200 414 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AHSA1O95433 338 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NUDT7P0C024 238 aa22.9■■□□□ 1.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 BMP4P12644 408 aa22.9■■□□□ 1.26
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