RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 TEKQ02763 1124 aa5.72□□□□□ -1.49
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HOXD8-202ENST00000429017 PTGR1Q14914 329 aa5.72□□□□□ -1.49
HOXD8-202ENST00000429017 PDK3Q15120 406 aa5.72□□□□□ -1.49
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HOXD8-202ENST00000429017 ZNF141Q15928 474 aa5.72□□□□□ -1.49
HOXD8-202ENST00000429017 SYT14P1Q58G82 188 aa5.72□□□□□ -1.49
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HOXD8-202ENST00000429017 SLC7A10Q9NS82 523 aa5.71□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TAS2R16Q9NYV7 291 aa5.71□□□□□ -1.5
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HOXD8-202ENST00000429017 MALT1Q9UDY8 824 aa5.71□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 TMED5Q9Y3A6 229 aa5.71□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 PMS2P2O95744 297 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 CSTAP01040 98 aa5.7□□□□□ -1.5
HOXD8-202ENST00000429017 VIMP08670 466 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
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