RNA–Protein interactions for RNA: YFR049W

YMR31, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene YMR31, Length 372 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR31	YFR049W	RPN12	P32496	274 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	AIM26	P32858	118 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	MDL2	P33311	773 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	POA1	P38218	177 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	EXO84	P38261	753 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HXT7	P39004	570 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	BNA2	P47125	453 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	JJJ3	P47138	172 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	ENT2	Q05785	613 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	PSR2	Q07949	397 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RSC58	Q07979	502 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	XYL2	Q07993	356 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	PEX15	Q08215	383 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YVC1	Q12324	675 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SAM35	P14693	329 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RPC82	P32349	654 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	SRP101	P32916	621 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	STE13	P33894	931 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	MNN4	P36044	1178 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YKR075C	P36155	307 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RFC5	P38251	354 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YAP1801	P38856	637 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	AKR1	P39010	764 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	MMM1	P41800	426 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	ENV11	P53246	860 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HDA1	P53973	706 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	YKR011C	Q02209	353 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HIM1	Q06674	414 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	HFI1	Q12060	488 aa		3.16	□□□□□ -1.9
YMR31	YFR049W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	GBP2	P25555	427 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.15	□□□□□ -1.91	not detected
YMR31	YFR049W	SFA1	P32771	386 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	OAF3	P36023	863 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	FLR1	P38124	548 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MAL31	P38156	614 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	FAT1	P38225	669 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	NOC2	P39744	710 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	AIM21	P40563	679 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SBE2	P42223	864 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	BUD9	P53226	547 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	RCM1	P53972	490 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	HPF1	Q05164	967 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YOR059C	Q08448	450 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	HAL9	Q12180	1030 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	DPH6	Q12429	685 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	NSI1	Q12457	570 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YLR149C	Q99296	730 aa		3.15	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SPS1	P08458	490 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	KIN2	P13186	1147 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MSH1	P25846	959 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PTC7	P38797	343 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ACA1	P39970	489 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	VPS27	P40343	622 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SAP185	P40856	1058 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	GTS1	P40956	396 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	QRI7	P43122	407 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	CIT3	P43635	486 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	TAF1	P46677	1066 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	UBA2	P52488	636 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	HOL1	P53389	586 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	NUR1	Q12066	484 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YOL114C	Q12322	202 aa		3.14	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	AI1	P03875	834 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	AI3	P03877	415 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	MSS18	P08593	268 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	HSF1	P10961	833 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ATP12	P22135	325 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YKR018C	P36114	725 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	SAW1	P39735	261 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YIL092W	P40497	633 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ERR3	P42222	437 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	IML2	P47031	731 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PRY1	P47032	299 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ASK10	P48361	1146 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	ZIP2	P53061	704 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	PCL10	P53124	433 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YGR035C	P53222	116 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	YML131W	Q03102	365 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	RSM24	Q03976	319 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	TRE1	Q08919	783 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	THI21	Q08975	551 aa		3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
YMR31	YFR049W	DCS2	Q12123	353 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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