RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	SNT2	P53127	1403 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PRD1	YCL057W	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PRD1	YCL057W	GAL10	P04397	699 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PRD1	YCL057W	DAL7	P21826	554 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PRD1	YCL057W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	5.78	□□□□□ -1.48
PRD1	YCL057W	ZRG8	P40021	1076 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PRD1	YCL057W	MND2	P40577	368 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PRD1	YCL057W	COG8	Q04632	607 aa		5.78	□□□□□ -1.48
PRD1	YCL057W	FBP1	P09201	348 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	PER1	P25625	357 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.77	□□□□□ -1.49	not detected
PRD1	YCL057W	HLJ1	P48353	224 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	SNP1	Q00916	300 aa	Predicted RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	YKR011C	Q02209	353 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	TY1B-JR2	P47100	1755 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	TY1B-ER2	Q03619	1755 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	TY1B-MR1	Q04214	1755 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	TY1B-MR2	Q04670	1755 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	TY1B-LR1	Q12088	1755 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	TY1B-NL1	Q12112	1755 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	TY1B-GR1	Q12141	1755 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	TY1B-BL	Q12490	1755 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	YCL002C	P25565	263 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	EBP2	P36049	427 aa	Known RBP	5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		5.77	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	GCN2	P15442	1659 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	RAD18	P10862	487 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	5.76	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	PMT3	P47190	753 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	PLB2	Q03674	706 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	THI73	Q07904	523 aa		5.76	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	SFL1	P20134	766 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	HOG1	P32485	435 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	YEN1	P40028	759 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	CEP3	P40969	608 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	MET13	P53128	600 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	SDA1	P53313	767 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	GDB1	Q06625	1536 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	MHP1	P43638	1398 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	RPD3	P32561	433 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	LIP5	P32875	414 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	GPG1	P53130	126 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	SSL1	Q04673	461 aa	Predicted RBP	5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	ADY3	Q07732	790 aa		5.75	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	ENA1	P13587	1091 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	MIH1	P23748	554 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	OMA1	P36163	345 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	RLP7	P40693	322 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	SNO2	P53823	222 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	VPS30	Q02948	557 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	SGD1	Q06132	899 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	DFG16	Q99234	619 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	ARO1	P08566	1588 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	IRC20	Q06554	1556 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	SPE1	P08432	466 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	ATG33	Q06485	197 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	GLT1	Q12680	2145 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	CDC6	P09119	513 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	ATG19	P35193	415 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	LRG1	P35688	1017 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	LAM1	P38851	1228 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	YGR237C	P50089	785 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	UME1	Q03010	460 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	THI21	Q08975	551 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	ALY2	P47029	1046 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	DUS4	Q06063	367 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	TPO1	Q07824	586 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	CAT8	P39113	1433 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	MET12	P46151	657 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	MRPL22	P53881	309 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	NHX1	Q04121	633 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	YDR338C	Q05497	695 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	HAL9	Q12180	1030 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PRD1	YCL057W	CDC25	P04821	1589 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
PRD1	YCL057W	IME2	P32581	645 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	POA1	P38218	177 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	MEF2	P39677	819 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	YIL108W	P40483	696 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	ROT1	Q03691	256 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	YOR022C	Q12204	715 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	TYS1	P36421	394 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	PAF1	P38351	445 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PRD1	YCL057W	YDR132C	Q03900	495 aa		5.71	□□□□□ -1.5

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