RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623117.1

GTSE1-AS1-202, humanhuman

BASIC

Gene GTSE1-AS1, Length 1,518 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 EPHA10Q5JZY3 1008 aa28.16■■■□□ 2.1
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CTSWP56202 376 aa28.15■■■□□ 2.1
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 C7orf43Q8WVR3 580 aa28.15■■■□□ 2.1
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ALDH1B1P30837 517 aa28.14■■■□□ 2.1
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SUCLG2Q96I99 432 aa28.14■■■□□ 2.1
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 TAF1P21675 1872 aa28.14■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 COL4A1P02462 1669 aa28.14■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CSF1RP07333 972 aa28.13■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PANK1Q8TE04 598 aa28.13■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SEC31BQ9NQW1 1179 aa28.13■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa28.12■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SLC51AQ86UW1 340 aa28.12■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MEIS3Q99687 375 aa28.12■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MYH3P11055 1940 aa28.11■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.11■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CACNA1SQ13698 1873 aa28.11■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GREM2Q9H772 168 aa28.1■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RTL9Q8NET4 1388 aa28.09■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 C21orf2O43822 256 aa28.08■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GRAPQ13588 217 aa28.08■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 OLFM4Q6UX06 510 aa28.08■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.08■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 LMBR1LQ6UX01 489 aa28.08■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ANKRD44Q8N8A2 993 aa28.08■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GRIN3BO60391 1043 aa28.07■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 BBOX1O75936 387 aa28.07■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP28.07■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 FAM161AQ3B820 660 aa28.06■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.05■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MS4A1P11836 297 aa28.05■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PDE3AQ14432 1141 aa28.04■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ITPRIPQ8IWB1 547 aa28.04■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SNED1Q8TER0 1413 aa28.04■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa28.03■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 DCAF8L1A6NGE4 600 aa28.02■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ITGA6P23229 1130 aa28.02■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.02■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GNAI3P08754 354 aa28.02■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa28.02■■■□□ 2.08
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SP8Q8IXZ3 490 aa28.01■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 COG6Q9Y2V7 657 aa28.01■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 NFKBIEO00221 500 aa28■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MVPQ14764 893 aaKnown RBP28■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP27.99■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa27.99■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CCDC93Q567U6 631 aa27.98■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SOGA3Q5TF21 947 aa27.98■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 TMC4Q7Z404 712 aa27.98■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa27.98■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CHMP3Q9Y3E7 222 aa27.98■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PRELPP51888 382 aa27.97■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa27.97■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa27.97■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 LRRC37AA6NMS7 1700 aa27.96■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 HDAC5Q9UQL6 1122 aa27.96■■■□□ 2.07
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GNAI2P04899 355 aa27.95■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RASSF7Q02833 373 aa27.95■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.95■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RTKN2Q8IZC4 609 aa27.95■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MTX1Q13505 466 aa27.93■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 DDX19BQ9UMR2 479 aa27.93■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 LTBP3Q9NS15 1303 aa27.93■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 C1orf115Q9H7X2 142 aa27.92■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa27.92■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MINPP1Q9UNW1 487 aa27.92■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SPEF2Q9C093 1822 aa27.91■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 SBF1O95248 1867 aa27.91■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GPSM2P81274 684 aa27.91■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP27.91■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 GRIPAP1Q4V328 841 aa27.91■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 KLHDC4Q8TBB5 520 aa27.91■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 PSMD1Q99460 953 aa27.91■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 TAOK3Q9H2K8 898 aa27.91■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 LTBP1Q14766 1721 aa27.89■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 DUOX1Q9NRD9 1551 aa27.89■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MPNDQ8N594 471 aa27.89■■■□□ 2.06
GTSE1-AS1-202ENST00000623117 MPHOSPH8Q99549 860 aa27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms