RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
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SGMS1-210ENST00000619438 ADCY9O60503 1353 aa26.87■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 CRY2Q49AN0 593 aa26.87■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 FAM89AQ96GI7 184 aa26.87■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.87■■□□□ 1.89
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SGMS1-210ENST00000619438 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.86■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 FLIIQ13045 1269 aa26.86■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
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SGMS1-210ENST00000619438 SOGA3Q5TF21 947 aa26.85■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 C9orf131Q5VYM1 1079 aa26.85■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 ABCC4O15439 1325 aa26.85■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 SLX4Q8IY92 1834 aa26.84■■□□□ 1.89
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SGMS1-210ENST00000619438 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.83■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa26.83■■□□□ 1.89
SGMS1-210ENST00000619438 RASSF7Q02833 373 aa26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 SMC5Q8IY18 1101 aa26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 RNF181Q9P0P0 153 aa26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.8■■□□□ 1.88
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SGMS1-210ENST00000619438 CCDC93Q567U6 631 aa26.79■■□□□ 1.88
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SGMS1-210ENST00000619438 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.79■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.79■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.78■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 TAOK3Q9H2K8 898 aa26.78■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa26.78■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP26.77■■□□□ 1.88
SGMS1-210ENST00000619438 IGKV5-2P06315 115 aa26.76■■□□□ 1.87
SGMS1-210ENST00000619438 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.76■■□□□ 1.87
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SGMS1-210ENST00000619438 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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SGMS1-210ENST00000619438 NEURL1BA8MQ27 555 aa26.73■■□□□ 1.87
SGMS1-210ENST00000619438 F6X3S4 739 aa26.73■■□□□ 1.87
SGMS1-210ENST00000619438 BBOX1O75936 387 aa26.73■■□□□ 1.87
SGMS1-210ENST00000619438 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.73■■□□□ 1.87
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SGMS1-210ENST00000619438 LTBP3Q9NS15 1303 aa26.71■■□□□ 1.87
SGMS1-210ENST00000619438 PDE8AO60658 829 aa26.7■■□□□ 1.87
SGMS1-210ENST00000619438 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.7■■□□□ 1.87
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SGMS1-210ENST00000619438 TIAM2Q8IVF5 1701 aa26.7■■□□□ 1.87
SGMS1-210ENST00000619438 CACNA1FO60840 1977 aa26.7■■□□□ 1.86
SGMS1-210ENST00000619438 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.7■■□□□ 1.86
SGMS1-210ENST00000619438 GCKRQ14397 625 aa26.69■■□□□ 1.86
SGMS1-210ENST00000619438 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.69■■□□□ 1.86
SGMS1-210ENST00000619438 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.69■■□□□ 1.86
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SGMS1-210ENST00000619438 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.67■■□□□ 1.86
SGMS1-210ENST00000619438 GCC1Q96CN9 775 aa26.67■■□□□ 1.86
SGMS1-210ENST00000619438 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
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SGMS1-210ENST00000619438 H7C1W4 665 aa26.66■■□□□ 1.86
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SGMS1-210ENST00000619438 SP8Q8IXZ3 490 aa26.66■■□□□ 1.86
SGMS1-210ENST00000619438 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
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SGMS1-210ENST00000619438 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SGMS1-210ENST00000619438 TMC4Q7Z404 712 aa26.64■■□□□ 1.86
SGMS1-210ENST00000619438 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.64■■□□□ 1.86
SGMS1-210ENST00000619438 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.63■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.63■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 TAF1P21675 1872 aa26.63■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 SLC51AQ86UW1 340 aa26.62■■□□□ 1.85
SGMS1-210ENST00000619438 MPNDQ8N594 471 aa26.62■■□□□ 1.85
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