RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617928.4

CYFIP1-208, Transcript of cytoplasmic FMR1 interacting protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CYFIP1, Length 6,793 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYFIP1-208ENST00000617928 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NCOA7Q8NI08 942 aa9.95□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TBC1D5Q92609 795 aa9.95□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 FLIIQ13045 1269 aa9.95□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 IPO4Q8TEX9 1081 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 GBP3Q9H0R5 595 aa9.95□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 MAP9Q49MG5 647 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 IKBKGQ9Y6K9 419 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 SHTN1A0MZ66 631 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 RFX1P22670 979 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 PTPN14Q15678 1187 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 DDB1Q16531 1140 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 LRRC27Q9C0I9 530 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ANXA1P04083 346 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 WTAPQ15007 396 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 AKNAD1Q5T1N1 836 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 SSH1Q8WYL5 1049 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 MRVI1Q9Y6F6 885 aa9.94□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 SP4Q02446 784 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 CLIP2Q9UDT6 1046 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 B4DLN1 442 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 GJC1P36383 396 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NUP160Q12769 1436 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 KRT13P13646 458 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 SLFN5Q08AF3 891 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 GIMAP7Q8NHV1 300 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ALDH1L2Q3SY69 923 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 CCDC183Q5T5S1 534 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 GJB2P29033 226 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TRIM47Q96LD4 638 aa9.93□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TERF1P54274 439 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 USP37Q86T82 979 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 BEGAINQ9BUH8 593 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 MAP3K1Q13233 1512 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NYXQ9GZU5 481 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 MCM3P25205 808 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ADAMTS12P58397 1594 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NEK1Q96PY6 1258 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NAPAP54920 295 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TSHZ3Q63HK5 1081 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 IMPG2Q9BZV3 1241 aa9.92□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NDC80O14777 642 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TRAF1Q13077 416 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ATP2B3Q16720 1220 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TMC6Q7Z403 805 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 DAPK1P53355 1430 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 STAT6P42226 847 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TRERF1Q96PN7 1200 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 KRT23Q9C075 422 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 NOD1Q9Y239 953 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 CCDC172P0C7W6 258 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 AFMP43652 599 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 SLC39A6Q13433 755 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 JAG2Q9Y219 1238 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 CTAGE5O15320 804 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 MAATS1Q7Z4T9 603 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 SIRT1Q96EB6 747 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 C6orf50Q9HD87 102 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 JADE2Q9NQC1 790 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 PTPRCP08575 1304 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 FAM83GA6ND36 823 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa9.91□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ACEP12821 1306 aa9.9□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.9□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 RRAGBQ5VZM2 374 aa9.9□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 TTC21BQ7Z4L5 1316 aa9.9□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.9□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 MCM5P33992 734 aa9.9□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 ESR2Q92731 530 aa9.9□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 KIAA0753Q2KHM9 967 aa9.9□□□□□ -0.82
CYFIP1-208ENST00000617928 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms