RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000605847.5

NEDD8-MDP1-204, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

TSL 5

Gene NEDD8-MDP1, Length 758 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C3orf67Q6ZVT6 689 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 MPNDQ8N594 471 aa20.44■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KIAA2012Q0VF49 1180 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PARP10Q53GL7 1025 aa20.43■□□□□ 0.86
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 C2orf69Q8N8R5 385 aa20.43■□□□□ 0.86
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCDC102AQ96A19 550 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ABCC4O15439 1325 aa20.43■□□□□ 0.86
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NUP98P52948 1817 aa20.43■□□□□ 0.86
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRPA1O75762 1119 aa20.41■□□□□ 0.86
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RNF186Q9NXI6 227 aa20.4■□□□□ 0.86
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC10A5Q5PT55 438 aa20.38■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DLK2Q6UY11 383 aa20.38■□□□□ 0.85
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SAMD7Q7Z3H4 446 aa20.38■□□□□ 0.85
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ADM5C9JUS6 153 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PSMD14O00487 310 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GRAPQ13588 217 aa20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 WASHC4Q2M389 1173 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TMC4Q7Z404 712 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CSRNP1Q96S65 589 aa20.33■□□□□ 0.85
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SLC10A3P09131 477 aa20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RPS12P25398 132 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SULF1Q8IWU6 871 aa20.32■□□□□ 0.84
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.32■□□□□ 0.84
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HDAC9Q9UKV0 1011 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 HPS5Q9UPZ3 1129 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa20.31■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RIMBP2O15034 1052 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EGFRP00533 1210 aa20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KDM3BQ7LBC6 1761 aa20.3■□□□□ 0.84
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PPP2R1AP30153 589 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NLRP10Q86W26 655 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GGA3Q9NZ52 723 aa20.28■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 SH3TC1Q8TE82 1336 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ECE2O60344 883 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 EYA3Q99504 573 aa20.27■□□□□ 0.84
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.27■□□□□ 0.84
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NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 CDCA5Q96FF9 252 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa20.26■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 G3V3G9 751 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANXA1P04083 346 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DOK7Q18PE1 504 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 DCAF8Q5TAQ9 597 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RASAL3Q86YV0 1011 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TSPYL4Q9UJ04 414 aa20.25■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LAMB2P55268 1798 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PDIA6Q15084 440 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 COPS6Q7L5N1 327 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 LRP10Q7Z4F1 713 aa20.24■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 FKBP1BP68106 108 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TCIRG1Q13488 830 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 NFE2L2Q16236 605 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 PROSER3Q2NL68 480 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 POLLQ9UGP5 575 aa20.23■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 RTL9Q8NET4 1388 aa20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 TBC1D8O95759 1140 aa20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 GPSM2P81274 684 aa20.21■□□□□ 0.83
NEDD8-MDP1-204ENST00000605847 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.21■□□□□ 0.83
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