RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579969.1

SNORD53-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 53, humanhuman

BASIC

Gene SNORD53, Length 78 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD53-201ENST00000579969 NCAPD2Q15021 1401 aa3.35□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 COL4A5P29400 1685 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ALDH1A1P00352 501 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 EGFRP00533 1210 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 MYCP01106 439 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 INHBEP58166 350 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 SREBF2Q12772 1141 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 MOB2Q70IA6 237 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 SUPT20HQ8NEM7 779 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 CD99L2Q8TCZ2 262 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 CDCA5Q96FF9 252 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 ERO1AQ96HE7 468 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 CARD11Q9BXL7 1154 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 POLKQ9UBT6 870 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 CDHR2Q9BYE9 1310 aa3.34□□□□□ -1.87
SNORD53-201ENST00000579969 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SCN11AQ9UI33 1791 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 RNMTO43148 476 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SP3Q02447 781 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 KIAA2012Q0VF49 1180 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 ARHGEF6Q15052 776 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 CRY2Q49AN0 593 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 TTC5Q8N0Z6 440 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 CRAMP1Q96RY5 1269 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 HTATIP2Q9BUP3 242 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF652Q9Y2D9 606 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SNED1Q8TER0 1413 aa3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 YDJCA8MPS7 323 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 PSMD14O00487 310 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 RPS12P25398 132 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 BMP8BP34820 402 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 CAP1Q01518 475 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 TCIRG1Q13488 830 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SCARF1Q14162 830 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SULT6B1Q6IMI4 303 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SLC51AQ86UW1 340 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 NUTM1Q86Y26 1132 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 IFNL1Q8IU54 200 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 AEBP1Q8IUX7 1158 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SP8Q8IXZ3 490 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SLC10A4Q96EP9 437 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 NYXQ9GZU5 481 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 KCNQ5Q9NR82 932 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 GGA3Q9NZ52 723 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 TJP1Q07157 1748 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 HTTP42858 3142 aa3.32□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 KIF7Q2M1P5 1343 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 RPTORQ8N122 1335 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 TMEM265A0A087WTH1 108 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 TNFRSF10AO00220 468 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 EVI5O60447 810 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 BBOX1O75936 387 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 BCAMP50895 628 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 MAP3K12Q12852 859 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 CRHR2Q13324 411 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 NEUROD1Q13562 356 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 PRKG1Q13976 671 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 MTFR1Q15390 333 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 HLFQ16534 295 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 LRIT3Q3SXY7 679 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SPRYD7Q5W111 196 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 ZNF790Q6PG37 636 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 NKX2-3Q8TAU0 364 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SH3TC2Q8TF17 1288 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SNX27Q96L92 541 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 TESK2Q96S53 571 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 CARD14Q9BXL6 1004 aa3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
SNORD53-201ENST00000579969 USP16Q9Y5T5 823 aa3.31□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72 ms