RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564764.5

RNPS1-211, Transcript of RNA binding protein with serine rich domain 1, human

TSL 3

Gene RNPS1, Length 639 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RNPS1-211	ENST00000564764	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	COL4A5	P29400	1685 aa		13.63	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	VAMP4	O75379	141 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	GPC2	Q8N158	579 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		13.62	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	PCNT	O95613	3336 aa		13.61	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	FLII	Q13045	1269 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	SLC51A	Q86UW1	340 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	MPND	Q8N594	471 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	TAF1	P21675	1872 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	PPIP5K2	O43314	1243 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	PDE8A	O60658	829 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	G2E3	Q7L622	706 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.58	□□□□□ -0.23
RNPS1-211	ENST00000564764	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	CAPN15	O75808	1086 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	LDHD	Q86WU2	507 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	HACL1	Q9UJ83	578 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	RTL9	Q8NET4	1388 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	COL4A1	P02462	1669 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	CCER2	I3L3R5	266 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	AOC3	Q16853	763 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	CHADL	Q6NUI6	762 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	MYH3	P11055	1940 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764		H7C1W4	665 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	EPHX2	P34913	555 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	CTSW	P56202	376 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	GCKR	Q14397	625 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764		E9PSI1	815 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	POTEI	P0CG38	1075 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	SCNN1D	P51172	638 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	CASP7	P55210	303 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	GPSM2	P81274	684 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	CXCL9	Q07325	125 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	WASHC4	Q2M389	1173 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	KLRG1	Q96E93	195 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	EYA3	Q99504	573 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	POLL	Q9UGP5	575 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	PASK	Q96RG2	1323 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RNPS1-211	ENST00000564764	TNIP1	Q15025	636 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	YDJC	A8MPS7	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	CSF1R	P07333	972 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	BEND3	Q5T5X7	828 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	JMY	Q8N9B5	988 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	CREBZF	Q9NS37	354 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	ZNF609	O15014	1411 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	XDH	P47989	1333 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	C6orf229	H3BNL8	230 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	EPS15	P42566	896 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RNPS1-211	ENST00000564764	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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