RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	28	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	COL4A1	P02462	1669 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	VAMP4	O75379	141 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	SLC4A2	P04920	1241 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	JDP2	Q8WYK2	163 aa		27.99	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	27.98	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV5-2	P06315	115 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	EXOSC9	Q06265	439 aa	Known RBP	27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	TMC4	Q7Z404	712 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	VPS33B	Q9H267	617 aa		27.97	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	LARGE2	Q8N3Y3	721 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF521	Q96K83	1311 aa		27.96	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	PCNT	O95613	3336 aa		27.95	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	GPC2	Q8N158	579 aa		27.95	■■■□□ 2.07
PPP4C-205	ENST00000563200	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	MPND	Q8N594	471 aa		27.94	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	27.93	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	PPIP5K2	O43314	1243 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	POTEI	P0CG38	1075 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	POTEJ	P0CG39	1038 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	FLII	Q13045	1269 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	AOC3	Q16853	763 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		27.92	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	PDE8A	O60658	829 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	LTBP1	Q14766	1721 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	NIM1K	Q8IY84	436 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	HACL1	Q9UJ83	578 aa		27.89	■■■□□ 2.06
PPP4C-205	ENST00000563200	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	HTRA3	P83110	453 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	CHADL	Q6NUI6	762 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	MYH3	P11055	1940 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	LDHD	Q86WU2	507 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	EPHX2	P34913	555 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		27.85	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200		H7C1W4	665 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	SCNN1D	P51172	638 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	GPSM2	P81274	684 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	CXCL9	Q07325	125 aa		27.84	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	CTSW	P56202	376 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	GCKR	Q14397	625 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	POLL	Q9UGP5	575 aa		27.83	■■■□□ 2.05
PPP4C-205	ENST00000563200	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	LINS1	Q8NG48	757 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TTLL11	Q8NHH1	800 aa		27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	27.82	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		27.81	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CCER2	I3L3R5	266 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CASP7	P55210	303 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	EAPP	Q56P03	285 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		27.8	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	RTL9	Q8NET4	1388 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PASK	Q96RG2	1323 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	YDJC	A8MPS7	323 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	EPS15	P42566	896 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	WASHC4	Q2M389	1173 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	KLRG1	Q96E93	195 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		27.79	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200		F6X3S4	739 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	LMOD1	P29536	600 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GREM2	Q9H772	168 aa		27.77	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	C6orf229	H3BNL8	230 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	BEND3	Q5T5X7	828 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKRD18A	Q8IVF6	992 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		27.76	■■■□□ 2.04
PPP4C-205	ENST00000563200		E9PSI1	815 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	RAD17	O75943	681 aa		27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	CDC5L	Q99459	802 aa	Known RBP	27.75	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	RIMBP2	O15034	1052 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	SLFN5	Q08AF3	891 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	TNIP1	Q15025	636 aa		27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
PPP4C-205	ENST00000563200	EYA3	Q99504	573 aa		27.74	■■■□□ 2.03

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