RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563065.5

CCNDBP1-204, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 1,450 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-204ENST00000563065 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 SEC31BQ9NQW1 1179 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.08■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.07■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 COL4A1P02462 1669 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 CTSWP56202 376 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 EPHA10Q5JZY3 1008 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 TTLL11Q8NHH1 800 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 USP44Q9H0E7 712 aa22.06■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCT4P50991 539 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 FOXO4P98177 505 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 SUCLG2Q96I99 432 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLA2G12BQ9BX93 195 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 GREM2Q9H772 168 aa22.04■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 PLIN1O60240 522 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 RASSF7Q02833 373 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRAPQ13588 217 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC152Q4G0S7 254 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 KAZALD1Q96I82 304 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 UTYO14607 1347 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 RLBP1P12271 317 aa22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 NFKBIEO00221 500 aa22.02■■□□□ 1.12
CCNDBP1-204ENST00000563065 BBOX1O75936 387 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 CSF1RP07333 972 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 PRELPP51888 382 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.01■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 FAM161AQ3B820 660 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 LMBR1LQ6UX01 489 aa22■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 MYH3P11055 1940 aa21.99■■□□□ 1.11
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CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC93Q567U6 631 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 MEIS3Q99687 375 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa21.99■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 PANK1Q8TE04 598 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.98■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITGA6P23229 1130 aa21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 SOGA3Q5TF21 947 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 SP8Q8IXZ3 490 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD44Q8N8A2 993 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.96■■□□□ 1.11
CCNDBP1-204ENST00000563065 SNED1Q8TER0 1413 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 RTL9Q8NET4 1388 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 CHD4Q14839 1912 aa21.95■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 C20orf194Q5TEA3 1177 aa21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 ITPRIPQ8IWB1 547 aa21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 RNF181Q9P0P0 153 aa21.93■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 SBF1O95248 1867 aa21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 YY1P25490 414 aa21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPSM2P81274 684 aa21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 LMNB1P20700 586 aa21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 TMC4Q7Z404 712 aa21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 MPNDQ8N594 471 aa21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.91■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC57Q2TAC2 916 aa21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 GNAI3P08754 354 aa21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 PSMD1Q99460 953 aa21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.9■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 SPEF2Q9C093 1822 aa21.89■■□□□ 1.1
CCNDBP1-204ENST00000563065 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 KLHDC4Q8TBB5 520 aa21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 COG6Q9Y2V7 657 aa21.89■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 POLLQ9UGP5 575 aa21.88■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 LRRC37AA6NMS7 1700 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
CCNDBP1-204ENST00000563065 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
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