RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.24□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 XYLBO75191 536 aa9.24□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 FIGNL1Q6PIW4 674 aa9.24□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 GAS2L1Q99501 681 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa9.24□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 MAN1A2O60476 641 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 FAM157BP0CG42 384 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 KCNQ4P56696 695 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 GRNP28799 593 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 NLRP13Q86W25 1043 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 PMEPA1Q969W9 287 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 TMEM63CQ9P1W3 806 aa9.22□□□□□ -0.93
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF76P36508 570 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 FANCCQ00597 558 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 USPL1Q5W0Q7 1092 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 RNF34Q969K3 372 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 C12orf49Q9H741 205 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 USP35Q9P2H5 1018 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.21□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 KCNH4Q9UQ05 1017 aa9.2□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 EFSO43281 561 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 LAMC2Q13753 1193 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 GALNT12Q8IXK2 581 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 CHRDQ9H2X0 955 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 FAM8A1Q9UBU6 413 aa9.19□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 H7C1W4 665 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 LAPTM4AQ15012 233 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
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TMOD3-208ENST00000560725 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 NPHS2Q9NP85 383 aa9.18□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa9.18□□□□□ -0.94
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TMOD3-208ENST00000560725 GFRA3O60609 400 aa9.17□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 CTSHP09668 335 aa9.17□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa9.17□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 NT5DC4Q86YG4 428 aa9.17□□□□□ -0.94
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TMOD3-208ENST00000560725 EFCC1Q9HA90 598 aa9.17□□□□□ -0.94
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TMOD3-208ENST00000560725 C1orf127Q8N9H9 656 aa9.16□□□□□ -0.94
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TMOD3-208ENST00000560725 SLC35F4A4IF30 521 aa9.15□□□□□ -0.94
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TMOD3-208ENST00000560725 EDN3P14138 238 aa9.15□□□□□ -0.94
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TMOD3-208ENST00000560725 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.15□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 KIFC2Q96AC6 838 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 GMCL1Q96IK5 515 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 OSBPL7Q9BZF2 842 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.15□□□□□ -0.94
TMOD3-208ENST00000560725 CNTN3Q9P232 1028 aa9.15□□□□□ -0.94
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TMOD3-208ENST00000560725 PHF20L1A8MW92 1017 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 C9orf131Q5VYM1 1079 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 OR13H1Q8NG92 308 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 BCO2Q9BYV7 579 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 GSX2Q9BZM3 304 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 CCSER2Q9H7U1 834 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 SENP2Q9HC62 589 aa9.14□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 TRAK1Q9UPV9 953 aa9.14□□□□□ -0.95
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TMOD3-208ENST00000560725 THBS1P07996 1170 aa9.13□□□□□ -0.95
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TMOD3-208ENST00000560725 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 HS2ST1Q7LGA3 356 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM22Q8IYM9 498 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 DRC1Q96MC2 740 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 PNMA5Q96PV4 448 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 AAASQ9NRG9 546 aa9.13□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 POTECB2RU33 542 aa9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
TMOD3-208ENST00000560725 SOX18P35713 384 aa9.12□□□□□ -0.95
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