RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCS1LQ9Y276 419 aa30.23■■■□□ 2.43
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ALDH1B1P30837 517 aa30.22■■■□□ 2.43
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CRAMP1Q96RY5 1269 aa30.22■■■□□ 2.43
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TAF1P21675 1872 aa30.21■■■□□ 2.43
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GPR162Q16538 588 aa30.21■■■□□ 2.43
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC152Q4G0S7 254 aa30.21■■■□□ 2.43
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DCAF8L1A6NGE4 600 aa30.17■■■□□ 2.42
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MEIS3Q99687 375 aa30.17■■■□□ 2.42
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EPHA10Q5JZY3 1008 aa30.16■■■□□ 2.42
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITPRIPQ8IWB1 547 aa30.16■■■□□ 2.42
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KAZALD1Q96I82 304 aa30.16■■■□□ 2.42
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GREM2Q9H772 168 aa30.14■■■□□ 2.42
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM161AQ3B820 660 aa30.12■■■□□ 2.41
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPEF2Q9C093 1822 aa30.12■■■□□ 2.41
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C21orf2O43822 256 aa30.11■■■□□ 2.41
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BBOX1O75936 387 aa30.11■■■□□ 2.41
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C7orf43Q8WVR3 580 aa30.11■■■□□ 2.41
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TAOK3Q9H2K8 898 aa29.97■■■□□ 2.39
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.97■■■□□ 2.39
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A0A1B0GUL6 1792 aa29.97■■■□□ 2.39
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa29.97■■■□□ 2.39
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP29.96■■■□□ 2.39
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.39
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MPNDQ8N594 471 aa29.95■■■□□ 2.39
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PSMD1Q99460 953 aa29.95■■■□□ 2.39
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa29.95■■■□□ 2.39
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