RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558936.5

RABGGTA-207, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
RABGGTA-207ENST00000558936 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
RABGGTA-207ENST00000558936 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP16.18■□□□□ 0.18
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RABGGTA-207ENST00000558936 ALDH1L2Q3SY69 923 aa16.14■□□□□ 0.17
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RABGGTA-207ENST00000558936 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-207ENST00000558936 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
RABGGTA-207ENST00000558936 GPSM2P81274 684 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-207ENST00000558936 SOGA3Q5TF21 947 aa16.13■□□□□ 0.17
RABGGTA-207ENST00000558936 POLLQ9UGP5 575 aa16.13■□□□□ 0.17
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RABGGTA-207ENST00000558936 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
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RABGGTA-207ENST00000558936 TBC1D16Q8TBP0 767 aa16.07■□□□□ 0.16
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RABGGTA-207ENST00000558936 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-207ENST00000558936 SCN4AP35499 1836 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-207ENST00000558936 CEP350Q5VT06 3117 aa16.05■□□□□ 0.16
RABGGTA-207ENST00000558936 SHTN1A0MZ66 631 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-207ENST00000558936 CXCL9Q07325 125 aa16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-207ENST00000558936 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
RABGGTA-207ENST00000558936 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
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