RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550376.5

PRDM4-205, Transcript of PR/SET domain 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRDM4, Length 2,591 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4-205ENST00000550376 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-205ENST00000550376 BARGINQ6ZT62 677 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-205ENST00000550376 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.33■■□□□ 1.65
PRDM4-205ENST00000550376 UBN2Q6ZU65 1347 aa25.32■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 DTNBO60941 627 aa25.32■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 IL15P40933 162 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 ANAPC15P60006 121 aa25.32■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 GREM2Q9H772 168 aa25.32■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 GSE1Q14687 1217 aa25.31■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.31■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.31■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 A0A1B0GUL7 405 aa25.31■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 ADCK5Q3MIX3 580 aa25.31■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC87Q9NVE4 849 aa25.31■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP25.3■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa25.3■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 TTLL11Q8NHH1 800 aa25.29■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 BCL9LQ86UU0 1499 aa25.29■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 PALLDQ8WX93 1383 aa25.29■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 GOLIM4O00461 696 aa25.29■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 ADORA1P30542 326 aa25.29■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 KCNJ4P48050 445 aa25.29■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 EP400Q96L91 3159 aa25.29■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 WNK3Q9BYP7 1800 aa25.28■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 CSF1RP07333 972 aa25.28■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 ITGA6P23229 1130 aa25.28■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 CEP126Q9P2H0 1117 aa25.28■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 TAF6LQ9Y6J9 622 aa25.28■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 LRP6O75581 1613 aa25.28■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 SNRKQ9NRH2 765 aa25.27■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.27■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 CHAMP1Q96JM3 812 aa25.27■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 HAUS7Q99871 368 aa25.27■■□□□ 1.64
PRDM4-205ENST00000550376 CASTP20810 708 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 SUSD4Q5VX71 490 aa25.26■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.26■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 USP21Q9UK80 565 aa25.26■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 CTSWP56202 376 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 VPS72Q15906 364 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.25■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 NECTIN1Q15223 517 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 PLA2G12BQ9BX93 195 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 ERVV-1B6SEH8 477 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 CIAO1O76071 339 aa25.24■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 JCADQ9P266 1359 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 MAP4K1Q92918 833 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 HIP1O00291 1037 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 CREB3L3Q68CJ9 461 aa25.23■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 AK2P54819 239 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 GORABQ5T7V8 394 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 PI16Q6UXB8 463 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 XAGE2Q96GT9 111 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 PAG1Q9NWQ8 432 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 TCEANC2Q96MN5 208 aa25.22■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 CAMTA2O94983 1202 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 LINC00116Q8NCU8 138 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 CNNM1Q9NRU3 951 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 SCARF1Q14162 830 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 METTL24Q5JXM2 366 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 IL17RAQ96F46 866 aa25.21■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 CDHR2Q9BYE9 1310 aa25.2■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 SNAP23O00161 211 aa25.2■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 TRAK2O60296 914 aa25.2■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 TTC14Q96N46 770 aa25.2■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 GPR108Q9NPR9 543 aa25.2■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 ZDHHC9Q9Y397 364 aa25.2■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa25.2■■□□□ 1.63
PRDM4-205ENST00000550376 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 TAF5LO75529 589 aa25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 RUFY3Q7L099 469 aa25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP25.2■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 ZNF609O15014 1411 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 SLC27A2O14975 620 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 PDE8AO60658 829 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 NUP98P52948 1817 aa25.19■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 MED23Q9ULK4 1368 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 MCM2P49736 904 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 SEC31BQ9NQW1 1179 aa25.18■■□□□ 1.62
PRDM4-205ENST00000550376 LARGE1O95461 756 aa25.17■■□□□ 1.62
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