RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548849.5

CS-214, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 1,028 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-214ENST00000548849 ECE1P42892 770 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-214ENST00000548849 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CS-214ENST00000548849 GRAPQ13588 217 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-214ENST00000548849 CST9Q5W186 159 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-214ENST00000548849 CIAPIN1Q6FI81 312 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-214ENST00000548849 CYP4F22Q6NT55 531 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-214ENST00000548849 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
CS-214ENST00000548849 ZNF428Q96B54 188 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-214ENST00000548849 CAPNS2Q96L46 248 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-214ENST00000548849 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.21■■□□□ 1.15
CS-214ENST00000548849 LAMB2P55268 1798 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 CHL1O00533 1208 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.2■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.19■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 TRPM7Q96QT4 1865 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 RAD17O75943 681 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 TNIP1Q15025 636 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 TLL2Q9Y6L7 1015 aa22.18■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.17■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 TAF1P21675 1872 aa22.16■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 CELF2O95319 508 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 TMC4Q7Z404 712 aa22.16■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.16■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 RUNDC1Q96C34 613 aa22.16■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.16■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.15■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 CDHR2Q9BYE9 1310 aa22.14■■□□□ 1.14
CS-214ENST00000548849 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 FAM89AQ96GI7 184 aa22.14■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 PGAP2Q9UHJ9 254 aa22.14■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 YDJCA8MPS7 323 aa22.13■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa22.13■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 H7C1D1 291 aa22.13■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 AOC2O75106 756 aa22.13■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 ZNF408Q9H9D4 720 aa22.13■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 HOXB7P09629 217 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 MAP2K2P36507 400 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 WASHC4Q2M389 1173 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 SAPCD2Q86UD0 394 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 TRPM4Q8TD43 1214 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.12■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 THSD7BQ9C0I4 1608 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 RIMBP2O15034 1052 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 CDC37L1Q7L3B6 337 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 ABHD8Q96I13 439 aa22.11■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 SHTN1A0MZ66 631 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 C6orf229H3BNL8 230 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 MICALL2Q8IY33 904 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 HYPKQ9NX55 129 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.1■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 DUSP27Q5VZP5 1158 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 CFAP44Q96MT7 982 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 DBNDD1Q9H9R9 158 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 TSKSQ9UJT2 592 aa22.09■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 PSMD14O00487 310 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 GPSM2P81274 684 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 USP48Q86UV5 1035 aa22.08■■□□□ 1.13
CS-214ENST00000548849 LRRC37AA6NMS7 1700 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 DPF2Q92785 391 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 HHIPL1Q96JK4 782 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 POLLQ9UGP5 575 aa22.07■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 DOK7Q18PE1 504 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 SAMD7Q7Z3H4 446 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 EYA3Q99504 573 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 MBIPQ9NS73 344 aa22.06■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 RPS8P62241 208 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 ECE2O60344 883 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 KCNQ5Q9NR82 932 aa22.04■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 CA12O43570 354 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 GOLGA2Q08379 1002 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 DLK2Q6UY11 383 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 TBC1D16Q8TBP0 767 aa22.03■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 COL4A1P02462 1669 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.02■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 RPS12P25398 132 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
CS-214ENST00000548849 HUNKP57058 714 aa22.02■■□□□ 1.12
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