RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536089.5

MDM2-223, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 1 (best)

Gene MDM2, Length 1,181 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-223	ENST00000536089	ARSD	P51689	593 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	BEND7	Q8N7W2	519 aa	Predicted RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	WHAMM	Q8TF30	809 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	BCS1L	Q9Y276	419 aa		6.56	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	6.56	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	SENP3-EIF4A1	A0A087X0R7	540 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	EPB42	P16452	691 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	ITGAE	P38570	1179 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	GJD3	Q8N144	294 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	CEP63	Q96MT8	703 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	ZIC5	Q96T25	663 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	MBIP	Q9NS73	344 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	WDR62	O43379	1518 aa		6.55	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089		A0A1W2PNR3	127 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089		A6NHS1	94 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	MSTN	O14793	375 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	ATP4A	P20648	1035 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	DSC3	Q14574	896 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	IER5	Q5VY09	327 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	ALKBH8	Q96BT7	664 aa	Known RBP	6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	RUBCNL	Q9H714	662 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	USP20	Q9Y2K6	914 aa		6.54	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	UBAP1L	F5GYI3	381 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	PSMD2	Q13200	908 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	TSNAXIP1	Q2TAA8	658 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	DUSP9	Q99956	384 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	RTCB	Q9Y3I0	505 aa	Known RBP	6.53	□□□□□ -1.36
MDM2-223	ENST00000536089	OPLAH	O14841	1288 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	F11	P03951	625 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	BCR	P11274	1271 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	EFHC2	Q5JST6	749 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	ALG1L	Q6GMV1	187 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	RIPOR1	Q6ZS17	1223 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	KLRG1	Q96E93	195 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	CSRNP1	Q96S65	589 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	PARP2	Q9UGN5	583 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		6.52	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	INPP5B	P32019	993 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	ORC1	Q13415	861 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	ENOX2	Q16206	610 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	FAM161B	Q96MY7	647 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	VTI1B	Q9UEU0	232 aa		6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	6.51	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	SORBS3	O60504	671 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	CPNE3	O75131	537 aa	Known RBP	6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	TCF3	P15923	654 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	GAS6	Q14393	721 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	BRD7	Q9NPI1	651 aa		6.5	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	IGF1R	P08069	1367 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	EIF1AY	O14602	144 aa	Known RBP	6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	PHACTR2	O75167	634 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	XYLB	O75191	536 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	IGHA2	P01877	340 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	VAMP1	P23763	118 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	TYRO3	Q06418	890 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	NLRP8	Q86W28	1048 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	GALNT6	Q8NCL4	622 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	DCAF5	Q96JK2	942 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	SETDB2	Q96T68	719 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	DNAJC25	Q9H1X3	360 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	CRISPLD1	Q9H336	500 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	PRDM2	Q13029	1718 aa		6.49	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	TTC39B	Q5VTQ0	682 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	ELP3	Q9H9T3	547 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	NLRP2	Q9NX02	1062 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	SPG7	Q9UQ90	795 aa		6.48	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	PIK3R2	O00459	728 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	TNFRSF21	O75509	655 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	MX2	P20592	715 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	MAP2K3	P46734	347 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	DAB2	P98082	770 aa		6.47	□□□□□ -1.37
MDM2-223	ENST00000536089	TMC4	Q7Z404	712 aa		6.47	□□□□□ -1.37

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