RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGAP45Q92619 1136 aa20.82■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP20.82■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDE8AO60658 829 aa20.81■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GRIPAP1Q4V328 841 aa20.81■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa20.81■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP20.81■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa20.81■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RTL9Q8NET4 1388 aa20.81■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.8■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 H7C1W4 665 aa20.8■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMC4Q7Z404 712 aa20.8■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PLA2G12BQ9BX93 195 aa20.8■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ABCC4O15439 1325 aa20.79■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa20.79■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SNED1Q8TER0 1413 aa20.79■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC152Q4G0S7 254 aa20.79■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC93Q567U6 631 aa20.79■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC4A10Q6U841 1118 aa20.79■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa20.79■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C7orf43Q8WVR3 580 aa20.79■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TIAM2Q8IVF5 1701 aa20.78■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAF1P21675 1872 aa20.78■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GRM8O00222 908 aa20.78■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CASP7P55210 303 aa20.78■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CTSWP56202 376 aa20.78■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP20.78■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa20.78■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C21orf2O43822 256 aa20.77■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BBOX1O75936 387 aa20.77■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GRAPQ13588 217 aa20.77■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP20.77■□□□□ 0.92
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UTYO14607 1347 aa20.77■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCT4P50991 539 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RTKN2Q8IZC4 609 aa20.76■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.75■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa20.75■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPEF2Q9C093 1822 aa20.74■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NFKBIEO00221 500 aa20.74■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LTBP1Q14766 1721 aa20.74■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LMNB1P20700 586 aa20.73■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 YY1P25490 414 aa20.73■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.73■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.72■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP20.72■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PSMD1Q99460 953 aa20.72■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 COL4A1P02462 1669 aa20.72■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BCAR3O75815 825 aa20.71■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATXN8OSP0DMR3 200 aa20.71■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRIM27P14373 513 aa20.71■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP20.71■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SP8Q8IXZ3 490 aa20.71■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP20.71■□□□□ 0.91
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CSF1RP07333 972 aa20.7■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RASSF7Q02833 373 aa20.7■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa20.7■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.69■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RPS8P62241 208 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A1B0GUL6 1792 aa20.68■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C9orf131Q5VYM1 1079 aa20.68■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GREM2Q9H772 168 aa20.68■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RNF181Q9P0P0 153 aa20.68■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HDAC5Q9UQL6 1122 aa20.68■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FOXO4P98177 505 aa20.67■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa20.67■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SUPT20HQ8NEM7 779 aa20.67■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.67■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 USP44Q9H0E7 712 aa20.67■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VPS33BQ9H267 617 aa20.67■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM161AQ3B820 660 aa20.66■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.66■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.66■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OLFM4Q6UX06 510 aa20.65■□□□□ 0.9
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MS4A1P11836 297 aa20.64■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ITGA6P23229 1130 aa20.64■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SUCLG2Q96I99 432 aa20.64■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.64■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa20.63■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IARSP41252 1262 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRELPP51888 382 aa20.63■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP20.63■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MPNDQ8N594 471 aa20.63■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 KAZALD1Q96I82 304 aa20.63■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PODXL2Q9NZ53 605 aa20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms