RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527303.1

PLEC-211, Transcript of plectin, humanhuman

TSL 3

Gene PLEC, Length 598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLEC-211ENST00000527303 LRRC37AA6NMS7 1700 aa28.29■■■□□ 2.12
PLEC-211ENST00000527303 TAF1P21675 1872 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEC-211ENST00000527303 ZNF853P0CG23 659 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEC-211ENST00000527303 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
PLEC-211ENST00000527303 TNS4Q8IZW8 715 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEC-211ENST00000527303 CHMP4AQ9BY43 222 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEC-211ENST00000527303 MBIPQ9NS73 344 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEC-211ENST00000527303 IFT57Q9NWB7 429 aa28.28■■■□□ 2.12
PLEC-211ENST00000527303 TRPM7Q96QT4 1865 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEC-211ENST00000527303 KIAA2012Q0VF49 1180 aa28.27■■■□□ 2.12
PLEC-211ENST00000527303 CDHR2Q9BYE9 1310 aa28.26■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 EPS15P42566 896 aa28.26■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 GNAI1P63096 354 aa28.26■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 SLC51AQ86UW1 340 aa28.26■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 RASSF10A6NK89 507 aa28.25■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 GPRC5DQ9NZD1 345 aa28.25■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 VEGFBP49765 207 aa28.24■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 CXCL9Q07325 125 aa28.24■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 APAF1O14727 1248 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 TNIP1Q15025 636 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 DEFB115Q30KQ5 88 aa28.23■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 FAM89AQ96GI7 184 aa28.22■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 GOLGA2Q08379 1002 aa28.21■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 CIAPIN1Q6FI81 312 aa28.21■■■□□ 2.11
PLEC-211ENST00000527303 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.2■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.2■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 AIDAQ96BJ3 306 aa28.2■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 DUOX1Q9NRD9 1551 aa28.19■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP28.17■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 PRDM10Q9NQV6 1147 aa28.17■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 BCL2L13Q9BXK5 485 aa28.16■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 PGAP2Q9UHJ9 254 aa28.16■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 FOXN1O15353 648 aa28.15■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP28.15■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 WASHC4Q2M389 1173 aa28.15■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.15■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 WBP1LQ9NX94 342 aa28.15■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP28.15■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 RAD17O75943 681 aa28.14■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 CCDC30Q5VVM6 783 aa28.14■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 EYA3Q99504 573 aa28.14■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP28.14■■■□□ 2.1
PLEC-211ENST00000527303 ECE1P42892 770 aa28.13■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 RPS8P62241 208 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP28.13■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 YDJCA8MPS7 323 aa28.12■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 DPF2Q92785 391 aa28.12■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 THSD7BQ9C0I4 1608 aa28.11■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 H7C1D1 291 aa28.11■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP28.11■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 CST9Q5W186 159 aa28.11■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 ZNF428Q96B54 188 aa28.11■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 C6orf229H3BNL8 230 aa28.1■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.1■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 C8orf58Q8NAV2 365 aa28.1■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 MYD88Q99836 296 aa28.1■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 PODXL2Q9NZ53 605 aa28.09■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 POLLQ9UGP5 575 aa28.09■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 TLL2Q9Y6L7 1015 aa28.09■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 TRAF5O00463 557 aa28.08■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 RPS12P25398 132 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 GPSM2P81274 684 aa28.08■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 CCDC27Q2M243 656 aa28.08■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 CCDC152Q4G0S7 254 aa28.08■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.08■■■□□ 2.09
PLEC-211ENST00000527303 PDE8AO60658 829 aa28.07■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 CDC37L1Q7L3B6 337 aa28.07■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 HHIPL1Q96JK4 782 aa28.07■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 CAPNS2Q96L46 248 aa28.07■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP28.06■■■□□ 2.088e-7■■■■□ 24.4
PLEC-211ENST00000527303 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 TBC1D16Q8TBP0 767 aa28.06■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 COL4A1P02462 1669 aa28.05■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 MYH3P11055 1940 aa28.05■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 MICALL2Q8IY33 904 aa28.05■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP28.05■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 DBNDD1Q9H9R9 158 aa28.05■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 CACNA1FO60840 1977 aa28.04■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 PSMD14O00487 310 aa28.04■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 RIMBP2O15034 1052 aa28.04■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 CAPN15O75808 1086 aa28.04■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 ECE2O60344 883 aa28.03■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 CELF2O95319 508 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 MAP2K2P36507 400 aa28.03■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
PLEC-211ENST00000527303 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.3 ms