RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522399.1

TTC13-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 13, human

TSL 4

Gene TTC13, Length 529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC13-208	ENST00000522399	TAF1	P21675	1872 aa		31.97	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	31.96	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.96	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	31.95	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	ZNRF3	Q9ULT6	936 aa		31.95	■■■□□ 2.71
TTC13-208	ENST00000522399	SCNN1D	P51172	638 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	SF3B3	Q15393	1217 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	CNTROB	Q8N137	903 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	LTBP1	Q14766	1721 aa		31.94	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		31.93	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	KIAA2012	Q0VF49	1180 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	RTL5	Q5HYW3	569 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	31.92	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		31.92	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	IRS4	O14654	1257 aa	Predicted RBP	31.91	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	EPS15	P42566	896 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		31.91	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	HSP90B1	P14625	803 aa	Known RBP	31.9	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	CCDC184	Q52MB2	194 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	CNTNAP1	P78357	1384 aa		31.9	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	CXCL9	Q07325	125 aa		31.89	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	31.89	■■■□□ 2.7
TTC13-208	ENST00000522399	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	31.88	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	ZBTB38	Q8NAP3	1195 aa	Predicted RBP	31.88	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	MYD88	Q99836	296 aa		31.88	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	CCDC27	Q2M243	656 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	CELF1	Q92879	486 aa	Known RBP	31.87	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		31.87	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		31.86	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		31.86	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	DUOX1	Q9NRD9	1551 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	TNIP1	Q15025	636 aa		31.85	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	31.85	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	COL13A1	Q5TAT6	717 aa	Predicted RBP	31.84	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	TSPYL6	Q8N831	410 aa		31.83	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	31.83	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	31.83	■■■□□ 2.69
TTC13-208	ENST00000522399	RAD17	O75943	681 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	WASHC4	Q2M389	1173 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	WWC1	Q8IX03	1113 aa		31.82	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	31.82	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	PCCA	P05165	728 aa	Predicted RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	RPS8	P62241	208 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	STK31	Q9BXU1	1019 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	MRS2	Q9HD23	443 aa		31.81	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	C6orf229	H3BNL8	230 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	ANP32C	O43423	234 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.79	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	PDE8A	O60658	829 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	VEGFB	P49765	207 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	GPSM2	P81274	684 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	EYA3	Q99504	573 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	COL4A1	P02462	1669 aa		31.78	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	IL16	Q14005	1332 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	RASSF10	A6NK89	507 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	YDJC	A8MPS7	323 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.77	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		31.76	■■■□□ 2.68
TTC13-208	ENST00000522399	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	31.76	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	POLL	Q9UGP5	575 aa		31.76	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	RIMBP2	O15034	1052 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		31.75	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		31.74	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	TNS4	Q8IZW8	715 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	TBC1D16	Q8TBP0	767 aa		31.73	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	31.73	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399		H7C1D1	291 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	PODXL2	Q9NZ53	605 aa		31.72	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	TRAF5	O00463	557 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	31.71	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	AIDA	Q96BJ3	306 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		31.71	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	ECE2	O60344	883 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	FMR1	Q06787	632 aa	Known RBP eCLIP	31.7	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	DPF2	Q92785	391 aa		31.7	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	ZC3H12C	Q9C0D7	883 aa	Known RBP	31.7	■■■□□ 2.67
TTC13-208	ENST00000522399	PSMD14	O00487	310 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC13-208	ENST00000522399	SLC4A2	P04920	1241 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC13-208	ENST00000522399	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC13-208	ENST00000522399	MICALL2	Q8IY33	904 aa		31.69	■■■□□ 2.66
TTC13-208	ENST00000522399	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		31.69	■■■□□ 2.66

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