RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 TMEM88BA6NKF7 163 aa14.55□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 CAPN15O75808 1086 aa14.55□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa14.55□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.55□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 DUSP27Q5VZP5 1158 aa14.55□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 NIM1KQ8IY84 436 aa14.55□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 MBIPQ9NS73 344 aa14.55□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 PPIP5K2O43314 1243 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 AOC3Q16853 763 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 NLRP10Q86W26 655 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 CNTROBQ8N137 903 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF428Q96B54 188 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 CNTNAP1P78357 1384 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 COL4A5P29400 1685 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 NUP98P52948 1817 aa14.54□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 ABCC4O15439 1325 aa14.53□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.53□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.53□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 CHPF2Q9P2E5 772 aa14.53□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 SCN4AP35499 1836 aa14.52□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.52□□□□□ -0.08
UBE2B-208ENST00000511807 EPS15P42566 896 aa14.52□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 SCNN1DP51172 638 aa14.52□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 TCIRG1Q13488 830 aa14.52□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa14.52□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 BBOX1O75936 387 aa14.51□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 VEGFBP49765 207 aa14.51□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.51□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.51□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 SP8Q8IXZ3 490 aa14.5□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 MPNDQ8N594 471 aa14.5□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 FOXN1O15353 648 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 GRAPQ13588 217 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 DEFB115Q30KQ5 88 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 PLBD2Q8NHP8 589 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 AIDAQ96BJ3 306 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 VPS33BQ9H267 617 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa14.49□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 HOXB7P09629 217 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.48□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 CXCL9Q07325 125 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 GPRC5DQ9NZD1 345 aa14.48□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 RASSF10A6NK89 507 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 KIAA2012Q0VF49 1180 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 FAM89AQ96GI7 184 aa14.47□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 LTBP1Q14766 1721 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 TRAF5O00463 557 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 RAD17O75943 681 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 CIAPIN1Q6FI81 312 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 ISCA1Q9BUE6 129 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 BCL2L13Q9BXK5 485 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 HYPKQ9NX55 129 aa14.46□□□□□ -0.09
UBE2B-208ENST00000511807 VAMP4O75379 141 aa14.45□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 GRM1Q13255 1194 aa14.45□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 TNIP1Q15025 636 aa14.45□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 TMC4Q7Z404 712 aa14.45□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 RIC3Q7Z5B4 369 aa14.44□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 TSPYL6Q8N831 410 aa14.44□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 WBP1LQ9NX94 342 aa14.44□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 RCAN3Q9UKA8 241 aa14.44□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 CCDC30Q5VVM6 783 aa14.43□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.42□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 YDJCA8MPS7 323 aa14.42□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 C6orf229H3BNL8 230 aa14.42□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 RIMBP2O15034 1052 aa14.42□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 LBX1P52954 281 aa14.42□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 WASHC4Q2M389 1173 aa14.42□□□□□ -0.1
UBE2B-208ENST00000511807 ALDH1L2Q3SY69 923 aa14.42□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms