RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511191.1

ACTN3-202, Transcript of actinin alpha 3 (gene/pseudogene), humanhuman

TSL 5

Gene ACTN3, Length 704 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3-202ENST00000511191 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.59■■□□□ 1.85
ACTN3-202ENST00000511191 MASTLQ96GX5 879 aa26.59■■□□□ 1.85
ACTN3-202ENST00000511191 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
ACTN3-202ENST00000511191 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
ACTN3-202ENST00000511191 RTL9Q8NET4 1388 aa26.58■■□□□ 1.85
ACTN3-202ENST00000511191 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.58■■□□□ 1.85
ACTN3-202ENST00000511191 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
ACTN3-202ENST00000511191 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.58■■□□□ 1.85
ACTN3-202ENST00000511191 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.58■■□□□ 1.85
ACTN3-202ENST00000511191 A0A0G2JLW4 131 aa26.57■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.57■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 ANKRD44Q8N8A2 993 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 CRAMP1Q96RY5 1269 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 MYH3P11055 1940 aa26.56■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 GNAI2P04899 355 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.55■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 ALDH1B1P30837 517 aa26.53■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.53■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 CNKSR1Q969H4 720 aa26.53■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 PIM2Q9P1W9 311 aa26.53■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 GREM2Q9H772 168 aa26.52■■□□□ 1.84
ACTN3-202ENST00000511191 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 MTX1Q13505 466 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.51■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 CRBNQ96SW2 442 aa26.51■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 TTLL6Q8N841 843 aa26.5■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 GRAPQ13588 217 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 FAM161AQ3B820 660 aa26.49■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 ITGA6P23229 1130 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.48■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 BBOX1O75936 387 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 AAMPQ13685 434 aa26.47■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.46■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 TMC4Q7Z404 712 aa26.46■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
ACTN3-202ENST00000511191 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 CCDC57Q2TAC2 916 aa26.45■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 C1orf115Q9H7X2 142 aa26.45■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.45■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 COL4A1P02462 1669 aa26.44■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 ATP8B2P98198 1209 aa26.44■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 C7orf43Q8WVR3 580 aa26.44■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP26.43■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 CEP85Q6P2H3 762 aa26.43■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.43■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 SLX4Q8IY92 1834 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 SRGAP3O43295 1099 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 POLA2Q14181 598 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.41■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 SP8Q8IXZ3 490 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 SSH3Q8TE77 659 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 BCS1LQ9Y276 419 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 TAF1P21675 1872 aa26.4■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.39■■□□□ 1.82
ACTN3-202ENST00000511191 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.39■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 SOGA3Q5TF21 947 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 COPRSQ9NQ92 184 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 FBXO3Q9UK99 471 aa26.38■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 LRRC37AA6NMS7 1700 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 TAF7LQ5H9L4 462 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 WWC3Q9ULE0 1092 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 CACNA1SQ13698 1873 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 C21orf2O43822 256 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 SIRT2Q8IXJ6 389 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 SNED1Q8TER0 1413 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa26.35■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 CCDC93Q567U6 631 aa26.34■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 KLHDC4Q8TBB5 520 aa26.34■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 HMMRO75330 724 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 CIAO1O76071 339 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 MINPP1Q9UNW1 487 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTN3-202ENST00000511191 EYA2O00167 538 aa26.32■■□□□ 1.8
ACTN3-202ENST00000511191 OLFM4Q6UX06 510 aa26.32■■□□□ 1.8
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