RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498594.5

CRAMP1-208, Transcript of cramped chromatin regulator homolog 1, human

TSL 4

Gene CRAMP1, Length 559 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CRAMP1-208	ENST00000498594	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	HNRNPU	Q00839	825 aa	Known RBP eCLIP	4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	DDR1	Q08345	913 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	FSTL1	Q12841	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	DCAF5	Q96JK2	942 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	FAM210A	Q96ND0	272 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	PIM2	Q9P1W9	311 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	TONSL	Q96HA7	1378 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	KDM2B	Q8NHM5	1336 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	RPS6KA4	O75676	772 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	UQCRH	P07919	91 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	TRDN	Q13061	729 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	CERS3	Q8IU89	383 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	IFNL2	Q8IZJ0	200 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	MFRP	Q9BY79	579 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	GRPEL1	Q9HAV7	217 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	MED4	Q9NPJ6	270 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	TAF1	P21675	1872 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	NUP98	P52948	1817 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	KIF16B	Q96L93	1317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	POTEC	B2RU33	542 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	GOLIM4	O00461	696 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	KCNJ4	P48050	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	EIF4A2	Q14240	407 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	SKOR2	Q2VWA4	1001 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	HSP90AB4P	Q58FF6	505 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	INTS5	Q6P9B9	1019 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	NFATC2IP	Q8NCF5	419 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	NBPF3	Q9H094	633 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	DONSON	Q9NYP3	566 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	DLG5	Q8TDM6	1919 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	POTEI	P0CG38	1075 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	POTEJ	P0CG39	1038 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	TM4SF1	P30408	202 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	CABP4	P57796	275 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	MFSD10	Q14728	455 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	SWT1	Q5T5J6	900 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	TSHZ1	Q6ZSZ6	1077 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	AEBP1	Q8IUX7	1158 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	ITFG2	Q969R8	447 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	OGFR	Q9NZT2	677 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	SCN7A	Q01118	1682 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	CENPF	P49454	3210 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CRAMP1-208	ENST00000498594	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		4.53	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	ERBB4	Q15303	1308 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	GLTPD2	A6NH11	291 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	NFKBIE	O00221	500 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	FOXN1	O15353	648 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZNF853	P0CG23	659 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	LIG1	P18858	919 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	LMNB1	P20700	586 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	MTHFS	P49914	203 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	FLII	Q13045	1269 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	SLC39A6	Q13433	755 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	HDAC1	Q13547	482 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	NFIX	Q14938	502 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	SYCP1	Q15431	976 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
CRAMP1-208	ENST00000498594	TACO1	Q9BSH4	297 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69

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