RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498280.1

RBM39-242, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 444 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-242ENST00000498280 MEGF10Q96KG7 1140 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-242ENST00000498280 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.6□□□□□ -1.51
RBM39-242ENST00000498280 FSTP19883 344 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-242ENST00000498280 DPYDQ12882 1025 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-242ENST00000498280 FLIIQ13045 1269 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-242ENST00000498280 PTK7Q13308 1070 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-242ENST00000498280 CCINQ13939 588 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-242ENST00000498280 IER5Q5VY09 327 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM39-242ENST00000498280 ILDR2Q71H61 639 aa5.59□□□□□ -1.51
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RBM39-242ENST00000498280 KLK14Q9P0G3 267 aa5.59□□□□□ -1.51
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RBM39-242ENST00000498280 CPB1P15086 417 aa5.58□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 SEC13P55735 322 aa5.58□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 STAG2Q8N3U4 1231 aa5.58□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 LPIN3Q9BQK8 851 aa5.58□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.58□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 ZFATQ9P243 1243 aa5.58□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP20Q9Y2K6 914 aa5.58□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 GSC2O15499 205 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 SSTR4P31391 388 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 CD97P48960 835 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 KRT25Q7Z3Z0 450 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 DCAF11Q8TEB1 546 aa5.57□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 TGFBR3LH3BV60 316 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 TARSP26639 723 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 FZD5Q13467 585 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 GRIK5Q16478 980 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 RTN1Q16799 776 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 ARXQ96QS3 562 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 AKTIPQ9H8T0 292 aa5.56□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 MAP3K6O95382 1288 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 INPP5BP32019 993 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 GPLD1P80108 840 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 PERM1Q5SV97 790 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 IFT43Q96FT9 208 aa5.55□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP5.55□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L15C9J2P7 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L10C9JJH3 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L13C9JLJ4 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L12C9JPN9 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L11C9JVI0 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L21D6R901 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L18D6R9N7 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L22D6RA61 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L17D6RBQ6 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L19D6RCP7 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L20D6RJB6 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 SASH3O75995 380 aa5.54□□□□□ -1.52
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RBM39-242ENST00000498280 IDH3AP50213 366 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 USP17L24Q0WX57 530 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 DGKZQ13574 1117 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 CDCA8Q53HL2 280 aa5.54□□□□□ -1.52
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RBM39-242ENST00000498280 HFE2Q6ZVN8 426 aa5.54□□□□□ -1.52
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RBM39-242ENST00000498280 ANKMY2Q8IV38 441 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 TRPM4Q8TD43 1214 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 TTC9Q92623 222 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 DLL1O00548 723 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 OPLAHO14841 1288 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 IGFBP4P22692 258 aa5.53□□□□□ -1.52
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RBM39-242ENST00000498280 LRFN2Q9ULH4 789 aa5.53□□□□□ -1.52
RBM39-242ENST00000498280 RNF114Q9Y508 228 aa5.53□□□□□ -1.52
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RBM39-242ENST00000498280 MICAL2O94851 1124 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 RARAP10276 462 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 WEE1P30291 646 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 GRIK1P39086 918 aa5.52□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 GP2P55259 537 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 MAP4K3Q8IVH8 894 aa5.52□□□□□ -1.53
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RBM39-242ENST00000498280 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 FAM196BA6NMK8 535 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 F8W735 103 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 GLB1P16278 677 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 Q6ZS46 218 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 TMEM130Q8N3G9 435 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 C11orf16Q9NQ32 467 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 RAXQ9Y2V3 346 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 J3QW42 95 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 TGFB1P01137 390 aa5.5□□□□□ -1.53
RBM39-242ENST00000498280 IGLV1-40P01703 118 aa5.5□□□□□ -1.53
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