RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496465.1

TM2D1-211, Transcript of TM2 domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TM2D1, Length 577 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D1-211ENST00000496465 EIF6P56537 245 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
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TM2D1-211ENST00000496465 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.5■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 PPIP5K2O43314 1243 aa23.48■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 EPHX2P34913 555 aa23.48■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 NIM1KQ8IY84 436 aa23.48■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 MPNDQ8N594 471 aa23.48■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 JMYQ8N9B5 988 aa23.48■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC191Q8NCU4 936 aa23.48■■□□□ 1.35
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TM2D1-211ENST00000496465 AOC3Q16853 763 aa23.47■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 MYD88Q99836 296 aa23.47■■□□□ 1.35
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TM2D1-211ENST00000496465 PCNTO95613 3336 aa23.46■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
TM2D1-211ENST00000496465 DUOX1Q9NRD9 1551 aa23.46■■□□□ 1.35
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TM2D1-211ENST00000496465 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.45■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 PASKQ96RG2 1323 aa23.44■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 KIAA2012Q0VF49 1180 aa23.44■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 KSR2Q6VAB6 950 aa23.44■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 WDR63Q8IWG1 891 aa23.44■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 STK31Q9BXU1 1019 aa23.44■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.44■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.43■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 MYH3P11055 1940 aa23.42■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 SCNN1DP51172 638 aa23.42■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 CREBZFQ9NS37 354 aa23.42■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.41■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.41■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.41■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 RPS8P62241 208 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 CXCL9Q07325 125 aa23.4■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 CLEC11AQ9Y240 323 aa23.4■■□□□ 1.34
TM2D1-211ENST00000496465 PDE8AO60658 829 aa23.39■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 SLC4A2P04920 1241 aa23.39■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 IGKV5-2P06315 115 aa23.39■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 EPS15P42566 896 aa23.39■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 CDHR2Q9BYE9 1310 aa23.38■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 G2E3Q7L622 706 aa23.38■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.37■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC152Q4G0S7 254 aa23.37■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 SEC31BQ9NQW1 1179 aa23.37■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 GPRC5DQ9NZD1 345 aa23.37■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 GPSM2P81274 684 aa23.36■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 WASHC4Q2M389 1173 aa23.36■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 CIAPIN1Q6FI81 312 aa23.36■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 CNTROBQ8N137 903 aa23.36■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 POLLQ9UGP5 575 aa23.36■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 VAMP4O75379 141 aa23.35■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 TNIP1Q15025 636 aa23.35■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.35■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 YDJCA8MPS7 323 aa23.34■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.34■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 FLIIQ13045 1269 aa23.34■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.34■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.33■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 TMEM88BA6NKF7 163 aa23.33■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 C6orf229H3BNL8 230 aa23.33■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 TBC1D16Q8TBP0 767 aa23.33■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
TM2D1-211ENST00000496465 RAD17O75943 681 aa23.32■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 EYA3Q99504 573 aa23.32■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 SPEF2Q9C093 1822 aa23.31■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 CTSWP56202 376 aa23.31■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 CNTNAP1P78357 1384 aa23.3■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 H7C1W4 665 aa23.3■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 RIMBP2O15034 1052 aa23.3■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 TTLL11Q8NHH1 800 aa23.3■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.3■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 SCN9AQ15858 1988 aa23.3■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 RTL9Q8NET4 1388 aa23.29■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 GCKRQ14397 625 aa23.29■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa23.29■■□□□ 1.32
TM2D1-211ENST00000496465 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.29■■□□□ 1.32
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