RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495522.1

CALD1-222, Transcript of caldesmon 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CALD1, Length 2,199 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALD1-222	ENST00000495522	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		18.37	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		18.37	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	RBSN	Q9H1K0	784 aa		18.37	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	CWC25	Q9NXE8	425 aa	Predicted RBP	18.37	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		18.37	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	SYCE3	A1L190	88 aa		18.36	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	USP48	Q86UV5	1035 aa		18.36	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	ESPN	B1AK53	854 aa		18.35	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	FOXO4	P98177	505 aa		18.35	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	TTLL7	Q6ZT98	887 aa		18.35	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		18.35	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		18.35	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	GJB2	P29033	226 aa		18.35	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	18.35	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	18.35	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	F13A1	P00488	732 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	HAUS7	Q99871	368 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	GDPD2	Q9HCC8	539 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	ABCA3	Q99758	1704 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	TAF5L	O75529	589 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	A1BG	P04217	495 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	ANKRD1	Q15327	319 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	ME3	Q16798	604 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	DDX54	Q8TDD1	881 aa	Known RBP	18.34	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	TJP1	Q07157	1748 aa		18.33	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	SHANK3	Q9BYB0	1731 aa		18.33	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	TNS2	Q63HR2	1409 aa		18.33	■□□□□ 0.53
CALD1-222	ENST00000495522	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	18.33	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		18.32	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	TPCN1	Q9ULQ1	816 aa		18.32	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	PHF14	O94880	888 aa		18.32	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	RPS6KB1	P23443	525 aa		18.32	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	ST3GAL1	Q11201	340 aa		18.32	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		18.32	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	18.32	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		18.32	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	TCHH	Q07283	1943 aa		18.31	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	GPR108	Q9NPR9	543 aa		18.31	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	KRT32	Q14532	448 aa		18.31	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	ATG9A	Q7Z3C6	839 aa		18.31	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		18.31	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	STRN4	Q9NRL3	753 aa		18.31	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	MTMR6	Q9Y217	621 aa		18.31	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	18.3	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	IL15	P40933	162 aa	Predicted RBP	18.3	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	NECAB1	Q8N987	351 aa		18.3	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF609	O15014	1411 aa		18.3	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	EVA1C	P58658	441 aa		18.3	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		18.3	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		18.29	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	MCMDC2	Q4G0Z9	681 aa		18.29	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		18.29	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	TSPY26P	Q9H489	355 aa		18.29	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	TAF6L	Q9Y6J9	622 aa		18.29	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522		U3KPZ7	1027 aa	Predicted RBP	18.29	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	UBE2H	P62256	183 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	18.28	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	TICAM2	Q86XR7	235 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	NEUROD6	Q96NK8	337 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	ATG3	Q9NT62	314 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		18.28	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	PALLD	Q8WX93	1383 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	EYA2	O00167	538 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		18.27	■□□□□ 0.52
CALD1-222	ENST00000495522	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	18.27	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CIAO1	O76071	339 aa		18.27	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	PDC	P20941	246 aa		18.27	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CCDC183	Q5T5S1	534 aa		18.27	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	FIBP	O43427	364 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	HS1BP3	Q53T59	392 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		18.26	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	NEK1	Q96PY6	1258 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	GOLIM4	O00461	696 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	LETM1	O95202	739 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	TIMM10	P62072	90 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	TCIRG1	Q13488	830 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	LRRC24	Q50LG9	513 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	DTNB	O60941	627 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	CHGB	P05060	677 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CALD1-222	ENST00000495522	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	18.24	■□□□□ 0.51

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