RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484266.5

CHKB-210, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 1,401 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-210ENST00000484266 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP41.58■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 C21orf2O43822 256 aa41.57■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 CTSWP56202 376 aa41.57■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 C7orf43Q8WVR3 580 aa41.57■■■■■ 4.25
CHKB-210ENST00000484266 CHD4Q14839 1912 aa41.57■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 UTYO14607 1347 aa41.56■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 COL4A1P02462 1669 aa41.55■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 CCDC152Q4G0S7 254 aa41.54■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP41.53■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa41.53■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 TTLL11Q8NHH1 800 aa41.53■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa41.53■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 GRAPQ13588 217 aa41.52■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 CLUAP1Q96AJ1 413 aa41.52■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP41.52■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 USP44Q9H0E7 712 aa41.52■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP41.51■■■■■ 4.24
CHKB-210ENST00000484266 OLFM4Q6UX06 510 aa41.49■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 SEC31BQ9NQW1 1179 aa41.49■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 FOXO4P98177 505 aa41.48■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 SOGA3Q5TF21 947 aa41.48■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP41.48■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 BBOX1O75936 387 aa41.47■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 SLC51AQ86UW1 340 aa41.47■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 RTL9Q8NET4 1388 aa41.47■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 CSF1RP07333 972 aa41.46■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 EPHA10Q5JZY3 1008 aa41.46■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 SUCLG2Q96I99 432 aa41.46■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 GREM2Q9H772 168 aa41.46■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 CCDC93Q567U6 631 aa41.45■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 SBF1O95248 1867 aa41.45■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 SNED1Q8TER0 1413 aa41.44■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 KAZALD1Q96I82 304 aa41.44■■■■■ 4.23
CHKB-210ENST00000484266 NFKBIEO00221 500 aa41.44■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa41.44■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 LRRC37AA6NMS7 1700 aa41.43■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 RASSF7Q02833 373 aa41.42■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 FAM161AQ3B820 660 aa41.42■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 TMEM57Q8N5G2 664 aa41.42■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 RPS8P62241 208 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa41.41■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 SPEF2Q9C093 1822 aa41.41■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 RLBP1P12271 317 aa41.4■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 TMC4Q7Z404 712 aa41.4■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP41.4■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa41.39■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 LMBR1LQ6UX01 489 aa41.39■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 SP8Q8IXZ3 490 aa41.39■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 MEIS3Q99687 375 aa41.38■■■■■ 4.22
CHKB-210ENST00000484266 ITGA6P23229 1130 aa41.37■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 RTKN2Q8IZC4 609 aa41.37■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP41.37■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 LTBP3Q9NS15 1303 aa41.37■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 TAOK3Q9H2K8 898 aa41.36■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa41.35■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 PLIN1O60240 522 aa41.35■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 PRELPP51888 382 aa41.35■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 RABL6Q3YEC7 729 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 CHMP3Q9Y3E7 222 aa41.35■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD44Q8N8A2 993 aa41.34■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 GRIPAP1Q4V328 841 aa41.33■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP41.32■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 PANK1Q8TE04 598 aa41.32■■■■■ 4.21
CHKB-210ENST00000484266 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa41.3■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 MS4A1P11836 297 aa41.3■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP41.3■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 PSMD1Q99460 953 aa41.3■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP41.29■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 GNAI3P08754 354 aa41.29■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 LMNB1P20700 586 aa41.29■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 LTBP1Q14766 1721 aa41.29■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 C9orf131Q5VYM1 1079 aa41.28■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 ITPRIPQ8IWB1 547 aa41.28■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 CCDC57Q2TAC2 916 aa41.27■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP41.27■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 RNF181Q9P0P0 153 aa41.27■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 HDAC5Q9UQL6 1122 aa41.27■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 DUOX1Q9NRD9 1551 aa41.26■■■■■ 4.2
CHKB-210ENST00000484266 MPNDQ8N594 471 aa41.26■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP41.25■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 TIAM2Q8IVF5 1701 aa41.23■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 YY1P25490 414 aa41.23■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP41.23■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 GPSM2P81274 684 aa41.22■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 MPHOSPH8Q99549 860 aa41.22■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP41.21■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 MINPP1Q9UNW1 487 aa41.2■■■■■ 4.19
CHKB-210ENST00000484266 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
CHKB-210ENST00000484266 IARSP41252 1262 aaKnown RBP41.18■■■■■ 4.18
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