RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481121.5

NELFE-208, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 2

Gene NELFE, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-208ENST00000481121 GRAPQ13588 217 aa26.47■■□□□ 1.83
NELFE-208ENST00000481121 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
NELFE-208ENST00000481121 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NELFE-208ENST00000481121 SSH1Q8WYL5 1049 aa26.47■■□□□ 1.83
NELFE-208ENST00000481121 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
NELFE-208ENST00000481121 GCKRQ14397 625 aa26.45■■□□□ 1.83
NELFE-208ENST00000481121 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.45■■□□□ 1.83
NELFE-208ENST00000481121 BCL2L13Q9BXK5 485 aa26.45■■□□□ 1.83
NELFE-208ENST00000481121 BBOX1O75936 387 aa26.44■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 GRIPAP1Q4V328 841 aa26.44■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa26.44■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa26.44■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 PTPRCP08575 1304 aa26.44■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 SLC51AQ86UW1 340 aa26.44■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 PSMD1Q99460 953 aa26.44■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 SMC4Q9NTJ3 1288 aa26.44■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.43■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 BEND3Q5T5X7 828 aa26.43■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.42■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 TMC4Q7Z404 712 aa26.42■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP26.42■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 H7C1W4 665 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 CTSWP56202 376 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 LTBP1Q14766 1721 aa26.41■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.4■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 SP8Q8IXZ3 490 aa26.4■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 IARSP41252 1262 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
NELFE-208ENST00000481121 DUOX1Q9NRD9 1551 aa26.39■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.38■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.38■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 CASP7P55210 303 aa26.37■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 WDR90Q96KV7 1748 aa26.37■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 ALDH1L1O75891 902 aa26.36■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 COL4A5P29400 1685 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 GLTPD2A6NH11 291 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 RPS8P62241 208 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 MPNDQ8N594 471 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 TTLL11Q8NHH1 800 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 PLA2G12BQ9BX93 195 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 RTL9Q8NET4 1388 aa26.35■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 GRM8O00222 908 aa26.34■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 SUPT20HQ8NEM7 779 aa26.34■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.34■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 DPY19L2Q6NUT2 758 aa26.34■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 GREM2Q9H772 168 aa26.34■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 RARSP54136 660 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 JDP2Q8WYK2 163 aa26.33■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 LARGE2Q8N3Y3 721 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 KIF16BQ96L93 1317 aa26.32■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 KIF3CO14782 793 aa26.31■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 PPIP5K2O43314 1243 aa26.31■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 A0A1B0GUL6 1792 aa26.31■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 SCN4AP35499 1836 aa26.31■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 AOC3Q16853 763 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 FAM161AQ3B820 660 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 VPS33BQ9H267 617 aa26.29■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 CSF1RP07333 972 aa26.28■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 RRAGCQ9HB90 399 aa26.28■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 ZNF541Q9H0D2 1346 aa26.28■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 FZD9O00144 591 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 ITGA6P23229 1130 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 GPSM2P81274 684 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 NIM1KQ8IY84 436 aa26.27■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
NELFE-208ENST00000481121 DDNO94850 711 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 C1QTNF8P60827 252 aa26.26■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 FOXO4P98177 505 aa26.26■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 KIAA2012Q0VF49 1180 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 CHMP3Q9Y3E7 222 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 UTYO14607 1347 aa26.25■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 C6orf229H3BNL8 230 aa26.24■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 EIF6P56537 245 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP26.24■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 PODXL2Q9NZ53 605 aa26.24■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 EPHA10Q5JZY3 1008 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 LMBR1LQ6UX01 489 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 SUCLG2Q96I99 432 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 XDHP47989 1333 aa26.23■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 WASHC4Q2M389 1173 aa26.22■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 TBC1D16Q8TBP0 767 aa26.22■■□□□ 1.79
NELFE-208ENST00000481121 EYA3Q99504 573 aa26.22■■□□□ 1.79
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