RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 CAPNS2Q96L46 248 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 PRDM10Q9NQV6 1147 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 ZNRF3Q9ULT6 936 aa14.68□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa14.68□□□□□ -0.06
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ACTB-209ENST00000473257 CHL1O00533 1208 aa14.67□□□□□ -0.06
ACTB-209ENST00000473257 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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ACTB-209ENST00000473257 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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ACTB-209ENST00000473257 DBNDD1Q9H9R9 158 aa14.64□□□□□ -0.07
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ACTB-209ENST00000473257 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
ACTB-209ENST00000473257 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
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ACTB-209ENST00000473257 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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ACTB-209ENST00000473257 PSMD14O00487 310 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-209ENST00000473257 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-209ENST00000473257 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
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ACTB-209ENST00000473257 USP48Q86UV5 1035 aa14.61□□□□□ -0.07
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ACTB-209ENST00000473257 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-209ENST00000473257 C6orf229H3BNL8 230 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-209ENST00000473257 TNIP1Q15025 636 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-209ENST00000473257 VPS33BQ9H267 617 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-209ENST00000473257 SEC31BQ9NQW1 1179 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-209ENST00000473257 THSD7BQ9C0I4 1608 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-209ENST00000473257 LRRC37AA6NMS7 1700 aa14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-209ENST00000473257 ECE1P42892 770 aa14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-209ENST00000473257 PGAP2Q9UHJ9 254 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-209ENST00000473257 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
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ACTB-209ENST00000473257 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 H7C1D1 291 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 APAF1O14727 1248 aa14.57□□□□□ -0.08
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ACTB-209ENST00000473257 C8orf58Q8NAV2 365 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 CFAP44Q96MT7 982 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 MYD88Q99836 296 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 BEGAINQ9BUH8 593 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 HYPKQ9NX55 129 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 CDC37L1Q7L3B6 337 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 SCN9AQ15858 1988 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-209ENST00000473257 CCDC85CA6NKD9 419 aa14.55□□□□□ -0.08
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